Четверин, Александр Борисович
Алекса́ндр Бори́сович Четвери́н (род. 20 мая 1953, Сальск, Ростовская область, РСФСР, СССР) — советский и российский молекулярный биолог[1], создатель метода молекулярных колоний[2]. Доктор биологических наук, профессор, член-корреспондент РАН[3].
Общие сведения
| Александр Борисович Четверин | |
|---|---|
| Дата рождения | 20 мая 1953 (73 года) |
| Место рождения | Сальск, Ростовская область, Россия |
| Страна | Россия |
| Научная сфера | молекулярная биология, биохимия |
| Место работы | Институт белка РАН |
| Образование | Московский государственный университет |
| Учёная степень | доктор биологических наук (1995) |
| Учёное звание |
профессор член-корреспондент РАН (1997) |
| Научный руководитель | Спирин А.С. |
| Ученики |
Марина Витальевна Фалеева Александр Андреевич Гордеев Зарина Шаймуратовна Кутлубаева |
| Известен как | создатель метода молекулярных колоний |
| Награды и премии | Премия имени А. Н. Белозерского (1995) |
| Сайт | protres.ru/unit/laborato… |
Биография
Родился 20 мая 1953 года в городе Сальск Ростовской области. В 1975 году окончил Московский государственный университет.
В 1985 году получил степень кандидата биологических наук. В 1995 году защитил докторскую диссертацию на тему «Реплицирующиеся РНК-векторы», получив степень доктора биологических наук. Имеет учёное звание профессора по специальности «молекулярная биология». 30 мая 1997 года был избран членом-корреспондентом Российской академии наук по секции физико-химической биологии.
Работает в Институте белка РАН в городе Пущино. С 1998 года является заведующим лабораторией биохимии вирусных РНК и главным научным сотрудником этого института.
Научная деятельность
Четверин работал в области генетической инженерии (создание векторов нового типа для клонирования матричной рибонуклеиновой кислоты — мРНК).
В 1991 году в Институте белка РАН Четвериным с сотрудниками был изобретён метод молекулярных колоний, суть которого состоит в том, что при создании соответствующих условий РНК или ДНК размножают в слое геля, благодаря чему потомство каждой молекулы образует колонию, а не распространяется по реакционному объёму. Поскольку матрикс геля предотвращает конвекцию заключённой в нём жидкости и ограничивает диффузию нуклеиновых кислот, продукты размножения не распространяются в реакционной среде, а образуют более или менее компактные молекулярные колонии наподобие колоний бактерий, растущих на поверхности питательного агара. Если размножение осуществляют в тонком слое геля, то образуется двумерный рисунок колоний, каждая из которых представляет собой многочисленные копии (клоны) одной исходной молекулы РНК или ДНК.
Метод молекулярных колоний позволил установить источник матриц в так называемом «безматричном» синтезе РНК, осуществляемом Qβ-репликазой (РНК-зависимой РНК-полимеразой бактериофага Qβ) в бесклеточной системе, а также исследовать in vitro крайне редкие реакции рекомбинаций между молекулами РНК, что привело к открытию способности молекул РНК спонтанно перестраивать свои нуклеотидные последовательности в физиологических условиях. Эти эксперименты косвенно свидетельствуют в пользу гипотезы РНК-мира.
Лабораторией Четверина были также разработаны разнообразные практические приложения метода молекулярных колоний, в том числе внеклеточное клонирование и скрининг генов, а также цифровая диагностика, обеспечивающая надёжное обнаружение одной молекулы ДНК и двух молекул РНК в 100 мкл цельной крови, что позволяет осуществлять сверхчувствительную диагностику вирусных и онкологических заболеваний.
В последующие годы лаборатория Четверина продолжила углублённое изучение Qβ-репликазы. В 2013 году было установлено, что рибосомный белок S1 функционирует как фактор терминации синтеза РНК, а в 2015 году была раскрыта структурная основа распознавания РНК-генома в процессе репликации. В 2024 году в журнале FEBS Letters была опубликована статья, посвящённая исследованию инициации синтеза РНК с помощью Qβ-репликазы. Работа показала, что для успешного старта синтеза праймеры должны быть короче определённой длины, а наличие трифосфатной группы на 5'-конце праймера значительно усиливает его активность, что отличает Qβ-репликазу от других РНК-полимераз. Эти исследования также поддерживают обсуждение гипотезы «мира РНК», о которой Четверин рассуждал в 2024 году, допуская возможность космического происхождения РНК на Земле[4].
Научное руководство
Под руководством А. Б. Четверина защитили кандидатские диссертации несколько учеников, продолживших научную и профессиональную деятельность в российских и зарубежных организациях:
- Марина Витальевна Фалалеева — в 2009 году защитила диссертацию на тему «Чувствительное и специфическое определение редких молекул РНК». Впоследствии работала в Университете Кентукки (США), является сотрудником американской биотехнологической компании Sangamo Therapeutics.
- Александр Андреевич Гордеев — в 2013 году защитил диссертацию на тему «Молекулярное клонирование с помощью двумерного дисплея клеток в слитых гелях»[5].
- Зарина Шаймуратовна Кутлубаева — в 2018 году защитила диссертацию на тему «Вклад рибосомного белка S1 в структуру и функцию Qβ-репликазы»[6]. Связана с Институтом белка РАН и биотехнологической компанией «Биокад»[7].
- Кирилл Владимирович Лободин — в 2025 году защитил диссертацию на тему «Особенности инициации и терминации синтеза РНК Qβ-репликазой»[8].
Награды и премии
В 1995 году Четверин А.Б. стал лауреатом премии имени А. Н. Белозерского за серию работ по созданию бесклеточной системы репликации, экспрессии и клонирования РНК.
Публикации
- Lobodin K.V., Chetverina H.V., Chetverin A.B. Probing the legitimate initiation of RNA synthesis by Qβ replicase with oligonucleotide primers // FEBS Letters. 2024[9][10].
- Chetverin A.B. Alexander Spirin on Molecular Machines and Origin of Life // Biochemistry (Moscow). 2021.
- Gordeev A.A., Chetverin A.B. Methods for Screening Live Cells // Biochemistry (Moscow), Suppl. 1. 2018.
- Chetverin A.B. Thirty Years of Studies of Qβ Replicase: What Have We Learned and What Is Yet to Be Learned? // Biochemistry (Moscow), Suppl. 1. 2018.
- Baranovskaya M.D., Ugarov V.I., Chetverina H.V., Chetverin A.B. Removal of protein S1 from escherichia coli ribosomes without the use of affinity chromatography // Analytical Biochemistry. 2017[11].
- Gytz H., Mohr D., Seweryn P., Yoshimura Y., Kutlubaeva Z., Dolman F., Chelchessa B., Chetverin A.B., Mulder F.A., Brodersen D.E., Knudsen C.R. Structural basis for RNA-genome recognition during bacteriophage Qβ replication // Nucleic Acids Research. 2015.
- Chetverina H.V., Chetverin A.B. Identifying RNA recombination events and non-covalent RNA-RNA interactions with the molecular colony technique // Methods in Molecular Biology. 2015.
- Gavrilov A.A., Chetverina H.V., Chermnykh E.S., Razin S.V., Chetverin A.B. Quantitative analysis of genomic element interactions by molecular colony technique // Nucleic Acids Research. 2014[11].
- Четверин А.Б., Четверина Е.В. 2002. Точная диагностика с помощью молекулярных колоний. Молекуляр. биология. 36.
- Четверин А.Б., Четверина Е.В. 2003. Преодоление проблем ПЦР-диагностики с помощью метода молекулярных колоний. Молекуляр. медицина. 2.
- Четверина Е.В., Четверин А.Б. 2008. Наноколонии: обнаружение, клонирование и анализ индивидуальных молекул. Успехи биол. химии. 48.
- Chetverin A.B., Chetverina H.V. 2008. Molecular colony technique: a new tool for biomedical research and clinical practice. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 82.
- Chetverin A.B., Chetverina H.V., Munishkin A.V. On the nature of spontaneous RNA synthesis by Qb replicase // J. Mol. Biol. 1991. V. 222. P. 3-9.
- Chetverina H.V., Chetverin A.B. Cloning of RNA molecules in vitro // Nucleic Acids Research. 1993. V. 21. P. 2349-2353. [1] PMID 7685078.
- Chetverina H.V., Demidenko А.А., Ugarov V.I., Chetverin A.B. Spontaneous rearrangements in RNA sequences // FEBS Letters. 1999. V. 450. P. 89-94.
- Munishkin A.V., Voronin L.A., Ugarov V.I., Bondareva L.A., Chetverina H.V. and Chetverin A.B. Efficient templates for Qb replicase are formed by recombination from heterologous sequences. - J. Mol. Biol., 1991, v. 221, p. 463-472.
- Morozov I.Yu., Ugarov V.I., Chetverin A.B. and Spirin A.S. Synergism in replication and translation of messenger RNA in a cell-free system. - Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1993, v. 90, p. 9325-9329.
- Chetverin A.B. and Kramer F.R. Oligonucleotide arrays: New concepts and possibilities. - Bio/Technology, 1994, v. 12, p. 1093-1099.
- Chetverin A.B. and Spirin A.S. Replicable RNA vectors: Prospects for cell-free gene amplification, expression and cloning. - Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol., 1995, v. 51, p. 225-270.
- Chetverin A.B., Chetverina H.V., Demidenko A.A. and Ugarov V.I. Nonhomologous RNA recombination in a cell-free system: evidence for a transesterification mechanism guided by secondary structure. – Cell, 1997, v. 88, p. 503-513.
- Chetverin A.B. and Chetverina H.V. Method for amplification of nucleic acids in solid media. U.S. Patent 5, 1997, v. 616, p. 478.
- Chetverin A.B. The puzzle of RNA recombination. FEBS Lett., 1999, v. 460, p. 1-5.
- Gmyl A.P., Belousov E.V., Maslova S.V., Khitrina E.V., Chetverin A.B. and Agol V.I. Nonreplicative RNA recombination in poliovirus. - J. Virol., 1999, v. 73, p. 8958-8965.
- Vasilyev N.N., Kutlubaeva Z.S., Ugarov V.I., Chetverina H.V., Chetverin A.B. Ribosomal protein S1 functions as a termination factor in RNA synthesis by Qβ phage replicase. - Nat. Commun., 2013, v. 4, article number 1781.
Патенты
- Четверин А.Б., Четверина Е.В. 1995. Способ размножения нуклеиновых кислот, способ их экспрессии и среда для их осуществления. Патент РФ № 2048522.
- Четверин А.Б., Четверина Е.В. 1998. Способ клонирования нуклеиновых кислот. Патент РФ № 2114175.
- Четверин А.Б., Четверина Е.В. 1998. Способ диагностики нуклеиновых кислот. Патент РФ № 2114915.
- Chetverin A.B., Chetverina H.V. 1997. Method for amplification of nucleic acids in solid media. U.S. Patent 5,616,478.
- Chetverin A.B., Chetverina H.V. 1999. Method for amplification of nucleic acids in solid media and its application for nucleic acid cloning and diagnostics. U.S. Patent 5,958,698.
- Chetverin A.B., Chetverina H.V. 1999. Solid medium for amplification and expression of nucleic acids as colonies. U.S. Patent 6,001,568.
Источники
Ссылки
- Пресс-портрет Четверин А.Б.
- Страница лаборатории биохимии вирусных РНК на сайте Института белка РАН
- Профиль Александра Борисовича Четверина на официальном сайте РАН
- Таксономия - Escherichia virus Qbeta ( вид )