Тромбоспондин-1

Тромбоспондин-1
Тромбоспондин-1
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1LSL, 1UX6, 1Z78, 1ZA4, 2ERF, 2ES3, 2OUH, 2OUJ, 3R6B, 5FOE
Идентификаторы
Псевдонимы	THBS1, THBS, THBS-1, TSP, TSP-1, TSP1, thrombospondin 1
Внешние ID	OMIM: 188060 MGI: 98737 HomoloGene: 31142 GeneCards: THBS1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	15-я хромосома человека
Конец	39,599,466 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	2-я хромосома мыши
Конец	117,957,614 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	stromal cell of endometrium; ; left uterine tube; ; upper lobe of left lung;
	Наибольшая экспрессия в
	body of femur; ; cumulus cell; ; endocardial cushion; ; right lung lobe; ; left lung lobe;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	calcium ion binding; heparin binding; extracellular matrix binding; fibroblast growth factor binding; phosphatidylserine binding; proteoglycan binding; collagen V binding; fibrinogen binding; low-density lipoprotein particle binding; integrin binding; laminin binding; fibronectin binding; связывание похожих белков; transforming growth factor beta binding; связывание с белками плазмы; extracellular matrix structural constituent;
Компонент клетки	endoplasmic reticulum lumen; Альфа-гранулы тромбоцитов; поверхность клетки; Эндоплазматический ретикулум; экзосома; внеклеточный матрикс; secretory granule; platelet alpha granule lumen; Фибриноген; Саркоплазматический ретикулум; наружная сторона клеточной мембраны; цитоплазма; внеклеточное пространство; внеклеточная область; collagen-containing extracellular matrix;
Биологический процесс	positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; cellular response to heat; negative regulation of fibrinolysis; protein O-linked fucosylation; response to progesterone; response to magnesium ion; positive regulation of translation; negative regulation of endothelial cell migration; negative regulation of cell-matrix adhesion; negative regulation of long-chain fatty acid import across plasma membrane; positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; positive regulation of blood coagulation; positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; positive regulation of macrophage chemotaxis; позитивная регуляция сигналов от протеинкиназы В; negative regulation of plasminogen activation; negative regulation of blood vessel endothelial cell migration; negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; response to endoplasmic reticulum stress; positive regulation of endothelial cell apoptotic process; response to unfolded protein; positive regulation of chemotaxis; negative regulation of cGMP-mediated signaling; positive regulation of phosphorylation; воспалительная реакция; negative regulation of focal adhesion assembly; chronic inflammatory response; negative regulation of nitric oxide mediated signal transduction; engulfment of apoptotic cell; extracellular matrix organization; positive regulation of macrophage activation; sprouting angiogenesis; негативная регуляция апоптоза; response to glucose; positive regulation of angiogenesis; response to calcium ion; positive regulation of transforming growth factor beta1 production; Агрегация клеток; behavioral response to pain; иммунный ответ; negative regulation of interleukin-12 production; positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; response to hypoxia; positive regulation of cell migration; platelet degranulation; negative regulation of endothelial cell chemotaxis; negative regulation of endothelial cell proliferation; positive regulation of endothelial cell migration; negative regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway; peptide cross-linking; negative regulation of antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; negative regulation of dendritic cell antigen processing and presentation; negative regulation of angiogenesis; миграция клеток; positive regulation of fibroblast migration; response to testosterone; cellular response to tumor necrosis factor; cellular response to growth factor stimulus; positive regulation of transforming growth factor beta production; response to mechanical stimulus; позитивная регуляция пролиферации клеток; positive regulation of smooth muscle cell proliferation; regulation of megakaryocyte differentiation; negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; negative regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis; negative regulation of sprouting angiogenesis;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	7057
	21825
	ENSG00000137801
	ENSMUSG00000040152
	P07996
	P35441
	NM_003246
	NM_011580; NM_001313914
	NP_003237
	н/д
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Тромбоспондин-1
Тромбоспондин-1
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1LSL, 1UX6, 1Z78, 1ZA4, 2ERF, 2ES3, 2OUH, 2OUJ, 3R6B, 5FOE
Идентификаторы
Псевдонимы	THBS1, THBS, THBS-1, TSP, TSP-1, TSP1, thrombospondin 1
Внешние ID	OMIM: 188060 MGI: 98737 HomoloGene: 31142 GeneCards: THBS1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	15-я хромосома человека
Конец	39,599,466 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	2-я хромосома мыши
Конец	117,957,614 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	stromal cell of endometrium; ; left uterine tube; ; upper lobe of left lung;
	Наибольшая экспрессия в
	body of femur; ; cumulus cell; ; endocardial cushion; ; right lung lobe; ; left lung lobe;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	calcium ion binding; heparin binding; extracellular matrix binding; fibroblast growth factor binding; phosphatidylserine binding; proteoglycan binding; collagen V binding; fibrinogen binding; low-density lipoprotein particle binding; integrin binding; laminin binding; fibronectin binding; связывание похожих белков; transforming growth factor beta binding; связывание с белками плазмы; extracellular matrix structural constituent;
Компонент клетки	endoplasmic reticulum lumen; Альфа-гранулы тромбоцитов; поверхность клетки; Эндоплазматический ретикулум; экзосома; внеклеточный матрикс; secretory granule; platelet alpha granule lumen; Фибриноген; Саркоплазматический ретикулум; наружная сторона клеточной мембраны; цитоплазма; внеклеточное пространство; внеклеточная область; collagen-containing extracellular matrix;
Биологический процесс	positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; cellular response to heat; negative regulation of fibrinolysis; protein O-linked fucosylation; response to progesterone; response to magnesium ion; positive regulation of translation; negative regulation of endothelial cell migration; negative regulation of cell-matrix adhesion; negative regulation of long-chain fatty acid import across plasma membrane; positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; positive regulation of blood coagulation; positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; positive regulation of macrophage chemotaxis; позитивная регуляция сигналов от протеинкиназы В; negative regulation of plasminogen activation; negative regulation of blood vessel endothelial cell migration; negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; response to endoplasmic reticulum stress; positive regulation of endothelial cell apoptotic process; response to unfolded protein; positive regulation of chemotaxis; negative regulation of cGMP-mediated signaling; positive regulation of phosphorylation; воспалительная реакция; negative regulation of focal adhesion assembly; chronic inflammatory response; negative regulation of nitric oxide mediated signal transduction; engulfment of apoptotic cell; extracellular matrix organization; positive regulation of macrophage activation; sprouting angiogenesis; негативная регуляция апоптоза; response to glucose; positive regulation of angiogenesis; response to calcium ion; positive regulation of transforming growth factor beta1 production; Агрегация клеток; behavioral response to pain; иммунный ответ; negative regulation of interleukin-12 production; positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; response to hypoxia; positive regulation of cell migration; platelet degranulation; negative regulation of endothelial cell chemotaxis; negative regulation of endothelial cell proliferation; positive regulation of endothelial cell migration; negative regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway; peptide cross-linking; negative regulation of antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; negative regulation of dendritic cell antigen processing and presentation; negative regulation of angiogenesis; миграция клеток; positive regulation of fibroblast migration; response to testosterone; cellular response to tumor necrosis factor; cellular response to growth factor stimulus; positive regulation of transforming growth factor beta production; response to mechanical stimulus; позитивная регуляция пролиферации клеток; positive regulation of smooth muscle cell proliferation; regulation of megakaryocyte differentiation; negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; negative regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis; negative regulation of sprouting angiogenesis;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	7057
	21825
	ENSG00000137801
	ENSMUSG00000040152
	P07996
	P35441
	NM_003246
	NM_011580; NM_001313914
	NP_003237
	н/д
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Тромбоспондин-1 (англ. thrombospondin 1, TSP1) — один из пяти известных тромбоспондинов, адгезивных белков, регулирующих взаимодействия клеток между собой и с внеклеточным матриксом. После синтеза молекулы тромбоспондина-1 объединяются в гомотримеры, взаимодействующие со множеством рецепторов, в том числе CD36, CD47 и интегринами. В одном исследовании показано взаимодействие TSP1 с рилиновыми рецепторами VLDLR и ApoER2 в ростральном миграционном тракте^[5].

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

Тромбоспондин-1

Примечания

Категории