Гентингтин

Гентингтин (англ. Huntingtin) — это белок[5], закодированный геном HTT (также HD). Функция нормальной формы этого белка неизвестна. Мутации в гене вызывают болезнь Гентингтона.

Что важно знать
Гентингтин
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3IO6, 3IOU, 3LRH, 4FE8, 4FEB, 4FEC, 4FED, 2LD0, 2LD2, 3IO4, 3IOR, 3IOT, 3IOV, 3IOW, 4RAV

Идентификаторы
ПсевдонимыHTT, HD, IT15, huntingtin, LOMARS
Внешние IDOMIM: 613004 MGI: 96067 HomoloGene: 1593 GeneCards: HTT
Расположение гена (человек)
Хр.4-я хромосома человека[1]
Локус4p16.3Начало3,041,363 bp[1]
Конец3,243,957 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.5-я хромосома мыши[2]
Локус5 B2|5 17.92 cMНачало34,919,084 bp[2]
Конец35,069,878 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002111
NM_001388492

NM_010414

RefSeq (белок)

NP_002102

NP_034544

Локус (UCSC)Chr 4: 3.04 – 3.24 MbChr 5: 34.92 – 35.07 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Структура

Структура белка гентингтина может быть самой разной, так как из-за полиморфизма гена в белке содержится разное количество остатков глутамина. Обычно их содержится от 6 до 35 (наибольшее зарегистрированное количество — около 250[6]). Молекулярная масса хантингтина в основном зависит именно от количества остатков глутамина. Белок обычно содержит 3144 аминокислоты.

Функция белка

Главная функция гентингтина точно не выяснена, однако достоверно известно, что он играет важную роль в нервных клетках. Внутри них он участвует в передаче сигналов, транспорте веществ, скреплении белков и защите клеток от апоптоза. Также известно, что белок повышает экспрессию BDNF на уровне транскрипции, однако механизм, с помощью которого гентингтин это делает, не установлен[7]. Гентингтин также необходим для нормального протекания эмбриогенеза, в экспериментах на мышах при отсутствии гомологичного гена эмбрион быстро погибал[8].

Взаимодействие с другими белками

Установлено, что гентингтин может непосредственно взаимодействовать с 19 видами белков. Шесть из них используются в регуляции транскрипции, другие четыре — в транспорте веществ, ещё три — в передаче сигналов, а у остальных шести функция неизвестна.

Болезнь Гентингтона

Болезнь Гентингтона возникает, если в гене вследствие мутации 36 раз и более встречается кодон CAG, кодирущий глутамин, из-за чего в белке происходит удлинение полиглутаминовой последовательности в N-конце, то есть глутаминовых остатков становится больше нормы, которая находится в диапазоне 6-35 остатков. В этом случае вместо нормального белка гентингтина Htt образуется его изменённый из-за мутации вариант mHtt. Считается, что болезнь Гентингтона возникает именно из-за усиления токсического эффекта mHtt.

Классификация нуклеотидной последовательности и статус болезни, который зависит от числа кодонов CAG

Число кодонов CAG Статус выраженности мутации Выраженность заболевания
<28 Норма Норма.
28-35 Промежуточный Норма, при передаче возможно увеличение числа повторов.
36-39 Частичная пенетрантность Шанс возникновения патологии относительно мал.
40 и выше Полная пенетрантность Вероятность развития болезни — 100 %.

Примечания

Ссылки