Байрох, Амос
Амос Байрох (фр. Amos Bairoch; 22 ноября 1957, Кламар — 29 ноября 2025)[1][2][3] — швейцарский биоинформатик[4][5][6]. Профессор биоинформатики на кафедре микробиологии и молекулярной медицины Женевского университета, где возглавляет группу CALIPHO[7] Швейцарского института биоинформатики (Swiss Institute of Bioinformatics — SIB).
В своей работе использует сочетание биоинформатики и экспериментальных методик для расширения знаний о функции генов, кодирующих белки, в геноме человека[8][9].
Отец — историк экономики Пауль Байрох.
Общие сведения
| Амос Байрох | |
|---|---|
| Дата рождения | 22 ноября 1957 |
| Место рождения | |
| Дата смерти | 29 ноября 2025 (68 лет) |
| Страна | |
| Место работы | |
| Образование |
|
| Награды и премии | |
Образование
Амос Байрох получил образование в Женевском университете[10]:
- 1981 год — степень бакалавра биохимии;
- 1981 год — степень бакалавра химии;
- 1983 год — диплом магистра биохимии;
- В 1990 году защитил докторскую диссертацию.
Его первым проектом в аспирантуре была разработка PC/ Gene[11], программного пакета на основе MS-DOS для анализа последовательностей белков и нуклеотидов. Этот проект был куплен сначала швейцарской компанией Genofit, затем Intelligenetics из США и Oxford Molecular из Великобритании.
Карьера
С 1982 по 1987 год — ассистент на кафедре медицинской биохимии в Женевском университете[10].
С 1987 по 1989 год — старший ассистент на кафедре медицинской биохимии.
С 1989 по 1994 — научный сотрудник, отвечал за разработку биокомпьютеров для медицинского факультета.
С 1995 года — доцент кафедры медицинской биохимии.
С 1998 года — один из основателей и руководитель группы Швейцарского института биоинформатики (Swiss Institute of Bioinformatics — SIB).
С 2001 года — адъюнкт-профессор биоинформатики на кафедре медицинской биохимии.
Исследования
Его основная работа связана с анализом последовательности белков и, в частности, с разработкой баз данных и программных средств для этой цели[12]. Его вклад — тщательное ручное аннотирование данных, связанных с белками[13].
Во время работы над PC/ Gene он начал разрабатывать базу данных аннотированных последовательностей белков, которая получила название SwissProt и была впервые представлена в июле 1986 года[14]. С 1988 года это был совместный проект с группой библиотек данных Европейской лаборатории молекулярной биологии, которая позже преобразовалась в Европейский институт биоинформатики (EBI).
База данных Swiss-Prot — основной источник информации о последовательности белков в мире и ключевой исследовательский инструмент для биоинформатиков[15]. Swiss-Prot наряду с американским информационным ресурсом по белкам (American Protein Information Resource — PIR) входит в самый полный в мире каталог информации о последовательностях и функциях белков — UniProt[16].
В 1988 году Байрох начал разрабатывать PROSITE[17], базу данных семейств и доменов белков. Некоторое время спустя он создал ENZYME[18][19][20][21][22], номенклатурную базу данных ферментов, а также SeqAnalRef, библиографическую справочную базу данных для анализа последовательностей[23][24].
В сотрудничестве с Роном Аппелем в августе 1993 года он инициировал создание первого сервера по молекулярной биологии — ExPASy[25].
В 1998 году вместе с коллегами из Женевского и Лозаннского университетов он был одним из основателей Швейцарского института биоинформатики SIB, который занимается исследованиями в области биоинформатики, разработками баз данных и инструментов для работы с ними[26].
В ноябре 1997 года вместе с Роном Аппелем и Денисом Хохштрассером он основал GeneBio (Geneva Bioinformatics SA), компанию, занимающуюся биологическими знаниями. Затем к ним присоединились Кит Роуз и Робин Офорд, и в апреле 2000 года они основали GeneProt (Geneva Proteomics), компанию по производству высокопроизводительной протеомики. Компания прекратила свою деятельность в 2005 году[27].
С 2009 года Амос Байрох в рамках CALIPHO group участвует в разработке neXtProt ресурса, цель которого — предоставить биологам широкий спектр знаний обо всех белках человека[28][29][30]. Он также участвует в разработке информационного ресурса Cellosaurus, посвящённого клеточным линиям.
По данным Google Scholar[12] и Scopus[12], по состоянию на 2015 год наиболее цитируемые рецензируемые статьи Амоса Байроха в научных журналах были опубликованы в Nucleic Acids Research[31][32][33][34][35], the Biochemical Journal[36][37], Nature[38], Briefings in Bioinformatics[39] и Database[40].
Награды и почётные звания
1993 год — лауреат премии Фридриха Мишера Швейцарского общества биохимиков
1995 год — поощрительная премия Фонда Хельмута Хортена
2004 год — премия Пера Эдмана
2004 год — Европейская премия Лациса
2010 год — премия Отто Негели
2011 год — премия HUPO за выдающиеся достижения в области протеомных наук[41]
2013 года — EUPA премия пионера протеомики
2018 год — премия ABRF
2021 — премия за исключительный вклад в области биокурации от Международного общества биокурации.
2025 — лауреат ISCB Accomplishments by a Senior Scientist Award — высшей формы признания, присуждаемой Международным обществом вычислительной биологии (ISCB) учёным за выдающийся вклад в области вычислительной биологии и биоинформатики[42].