Выделение семенных растений в отдельную группу относится к началу XX века, когда на смену делению растений на тайнобрачные, или криптогамы (лат. Cryptogamae), — с «невидимыми» половыми органами и явнобрачные, или фанерогамы (лат. Phanerogamae), — с заметными репродуктивными структурами пришла новая система, согласно которой растения делились на четыре группы:
- Низшие растения, или талломные, или слоевцовые (Thallophyta);
- Моховидные (Bryophyta);
- Папоротниковидные (Pteridophyta);
- Семенные растения (Spermatophyta).
Семенные растения считались ботаническим таксоном в ранге надотдела и включали два отдела:
- Голосеменные (Gymnospermae);
- Покрытосеменные (Angiospermae).