АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

PRSS22

PRSS22, ε-Триптаза (англ. Brain-specific serine protease 4, BSSP-4; tryptase epsilon; Шифр КФ 3.4.21.59) — фермент триптаза, продукт гена человека PRSS22[5][6][7].

Общие сведения
PRSS22
Идентификаторы
ПсевдонимыPRSS22, BSSP-4, hBSSP-4, SP001LA, protease, serine 22, serine protease 22
Внешние IDOMIM: 609343 MGI: 1918085 HomoloGene: 23344 GeneCards: PRSS22
Расположение гена (человек)
Хр.16-я хромосома человека[1]
Локус16p13.3Начало2,852,730 bp[1]
Конец2,858,170 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.17-я хромосома мыши[2]
Локус17 A3.3|17 12.18 cMНачало24,212,508 bp[2]
Конец24,217,074 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • minor salivary gland

  • body of pancreas

  • right uterine tube

  • right lobe of thyroid gland

  • left lobe of thyroid gland
Наибольшая экспрессия в
  • conjunctival fornix

  • superior cervical ganglion
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

64063

70835

Ensembl

ENSG00000005001
ENSG00000282937

ENSMUSG00000045027

UniProt

Q9GZN4

Q9ER10

RefSeq (мРНК)

NM_022119

NM_133731

RefSeq (белок)

NP_071402

NP_598492

Локус (UCSC)Chr 16: 2.85 – 2.86 MbChr 17: 24.21 – 24.22 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Структура

Триптаза эпсилон (ε-триптаза) состоит из 317 аминокислот, молекулярная масса 33,7 кДа.

Функции

Триптазы входят в семейство S1 трипсино-подобных сериновых протеаз. Они каталитически активны в тетрамерной форме, стабилизируемой гепарином, и устойчивы к известным эндогенным ингибиторам протеаз. Несколько генов триптаз сгруппированы на хромосоме 16p13.3 и обладают некоторыми общими свойствами. Все эти гены имеют высококонсервативные участки 3' UTR и содержат тандемные повторы на 5'-конце, а их 3' UTR участок играет роль в регуляции стабильности их мРНК. Гены содержат интрон непосредственно после инициирующего Met-кодона, отделяющего Met-кодон от кодирующей белок последовательности. Такая особенность структуры гена характерна в основном только для триптаз[5].

Ген ε-триптазы экпрессирован в воздуховодных путях и регулируется в ходе развития лёгких[5].

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 ENSG00000282937 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000005001, ENSG00000282937 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045027 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ 1 2 3 Entrez Gene: protease.
  6. ↑ Wong G. W., Yasuda S., Madhusudhan M. S., Li L., Yang Y., Krilis S. A., Sali A., Stevens R. L. Human tryptase epsilon (PRSS22), a new member of the chromosome 16p13.3 family of human serine proteases expressed in airway epithelial cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — December (vol. 276, no. 52). — P. 49169—49182. — doi:10.1074/jbc.M108677200. — PMID 11602603.
  7. ↑ Yasuda S., Morokawa N., Wong G. W., Rossi A., Madhusudhan M. S., Sali A., Askew Y. S., Adachi R., Silverman G. A., Krilis S. A., Stevens R. L. Urokinase-type plasminogen activator is a preferred substrate of the human epithelium serine protease tryptase epsilon/PRSS22 (англ.) // Blood (журнал) : journal. — American Society of Hematology, 2005. — May (vol. 105, no. 10). — P. 3893—3901. — doi:10.1182/blood-2003-10-3501. — PMID 15701722. — PMC 1895090.

Литература

  • Clark H. F., Gurney A. L., Abaya E., etal. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment (англ.) // Genome Res. : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
  • Martin J., Han C., Gordon L. A., etal. The sequence and analysis of duplication-rich human chromosome 16 (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 432, no. 7020. — P. 988—994. — doi:10.1038/nature03187. — PMID 15616553.
  • Mitsui S., Okui A., Kominami K., etal. A novel serine protease highly expressed in the pancreas is expressed in various kinds of cancer cells (англ.) // FEBS J. : journal. — 2005. — Vol. 272, no. 19. — P. 4911—4923. — doi:10.1111/j.1742-4658.2005.04901.x. — PMID 16176265.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.

Категории