АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

POLR2C

Субъединица RPB3 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II  — фермент, кодируемый у человека геном POLR2C .[1]

Что важно знать
Полипептид C РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Идентификаторы
Символ POLR2C ; RPB3; RPB31; hRPB33; hsRPB3
Внешние ID OMIM: 180663 MGI: 109299 HomoloGene: 2017 GeneCards: Ген POLR2C
номер EC 2.7.7.6
Генная онтология
Функция • RNA polymerase II activity

• DNA binding

• protein dimerization activity
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• DNA-directed RNA polymerase II, core complex
• nucleolus
• cytoplasm

• microtubule cytoskeleton
Биологический процесс • mRNA splicing, via spliceosome

• DNA repair
• transcription-coupled nucleotide-excision repair
• nucleotide-excision repair
• transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• 7-methylguanosine mRNA capping
• RNA splicing
• gene expression
• viral process

• positive regulation of viral transcription
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
PBB GE POLR2C 208996 s at tn.png
PBB GE POLR2C 214263 x at tn.png
PBB GE POLR2C 216282 x at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5432 20021
Ensembl ENSG00000102978 ENSMUSG00000031783
UniProt P19387 E9Q898
RefSeq (мРНК) NM_002694 NM_009090
RefSeq (белок) NP_116558 NP_033116
Локус (UCSC) Chr 16:
57.5 – 57.51 Mb		 Chr 8:
94.86 – 94.86 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Функция

Этот ген кодирует третью по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез мессенджера РНК у эукариот. Продукт этого гена содержит богатую цистеином область и существует в виде гетеродимера с другой полимеразной субъединицей, POLR2J. Эти две субъединицы образуют основной блок полимеразы. Псевдоген был идентифицирован на хромосоме 21.[2]

Взаимодействия

POLR2C, как было выявлено, взаимодействуют с:

Примечания

Литература

  • Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // Journal of Biomedical Science : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
  • Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
  • Romano G., Kasten M., De Falco G., Micheli P., Khalili K., Giordano A. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression. (англ.) // Journal of Cellular Biochemistry : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
  • Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
  • Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention. (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
  • Harrich D., McMillan N., Munoz L., Apolloni A., Meredith L. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
  • Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., Chen C.H., Rosen C.A., Roeder R.G. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors. (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
  • Pati U.K., Weissman S.M. The amino acid sequence of the human RNA polymerase II 33-kDa subunit hRPB 33 is highly conserved among eukaryotes. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1990. — Vol. 265, no. 15. — P. 8400—8403. — PMID 2187864.
  • Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
  • Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
  • Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor. (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
  • Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
  • Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function. (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
  • Agostini I., Navarro J.M., Rey F., Bouhamdan M., Spire B., Vigne R., Sire J. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB. (англ.) // Journal of Molecular Biology : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
  • Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat. (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
  • Okamoto H., Sheline C.T., Corden J.L., Jones K.A., Peterlin B.M. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
  • Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.
  • Parada C.A., Roeder R.G. Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain. (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 6607. — P. 375—378. — doi:10.1038/384375a0. — PMID 8934526.
  • García-Martínez L.F., Ivanov D., Gaynor R.B. Association of Tat with purified HIV-1 and HIV-2 transcription preinitiation complexes. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 11. — P. 6951—6958. — doi:10.1074/jbc.272.11.6951. — PMID 9054383.