АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

POLR2B

Субъединица RPB2 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II  — фермент, кодируемый у человека геном POLR2B .[1][2]

Этот ген кодирует вторую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. Эта субъединица, в комбинации по меньшей мере с двумя другими субъединицами полимеразы, образует структуру в полимеразе, которая поддерживает контакт в активном центре фермента между ДНК-матрицей и вновь синтезированной РНК.[3]

Что важно знать
Полипептид B РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Идентификаторы
Символ POLR2B ; POL2RB; RPB2; hRPB140; hsRPB2
Внешние ID OMIM: 180661 MGI: 2388280 HomoloGene: 722 GeneCards: Ген POLR2B
номер EC 2.7.7.6
Генная онтология
Функция • DNA binding

• chromatin binding
• DNA-directed RNA polymerase activity
• protein binding
• ribonucleoside binding
• poly(A) RNA binding

• metal ion binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• DNA-directed RNA polymerase II, core complex
• nucleolus

• membrane
Биологический процесс • mRNA splicing, via spliceosome

• DNA repair
• transcription-coupled nucleotide-excision repair
• nucleotide-excision repair
• transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• 7-methylguanosine mRNA capping
• RNA splicing
• gene expression
• viral process

• positive regulation of viral transcription
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
PBB GE POLR2B 201803 at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5431 231329
Ensembl ENSG00000047315 ENSMUSG00000029250
UniProt P30876 Q8CFI7
RefSeq (мРНК) NM_000938 NM_153798
RefSeq (белок) NP_000929 NP_722493
Локус (UCSC) Chr 4:
57.84 – 57.9 Mb		 Chr 5:
77.31 – 77.35 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Взаимодействия

POLR2B, как было выявлено, взаимодействует с POLR2C,[4] POLR2E,[4] POLR2H[4] и POLR2L[4].

Примечания

Литература

  • Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // Journal of Biomedical Science : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
  • Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
  • Romano G; Kasten M; De Falco G; Micheli, Pietro; Khalili, Kamel; Giordano, Antonio. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression (англ.) // Journal of Cellular Biochemistry : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
  • Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
  • Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
  • Harrich D; McMillan N; Munoz L; Apolloni, Ann; Meredith, Luke. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
  • Kato H; Sumimoto H; Pognonec P; Chen, C H; Rosen, C A; Roeder, R G. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
  • Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
  • Zheng X.M., Black D., Chambon P., Egly J.M. Sequencing and expression of complementary DNA for the general transcription factor BTF3 (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 344, no. 6266. — P. 556—559. — doi:10.1038/344556a0. — PMID 2320128.
  • Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
  • Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
  • Andersson B; Wentland MA; Ricafrente JY; Liu, W; Gibbs, R.A. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction (англ.) // Analytical Biochemistry : journal. — 1996. — Vol. 236, no. 1. — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
  • Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
  • Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
  • Agostini I; Navarro JM; Rey F; Bouhamdan, M; Spire, B; Vigne, R; Sire, J. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB (англ.) // Journal of Molecular Biology : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
  • Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
  • Okamoto H; Sheline CT; Corden JL; Jones, KA; Peterlin, B.M. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
  • Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.