АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыМатериалы БРЭСпецпроектыСтать автором
Настроить видСменить язык
О РУВИКИ
Ответ на вопрос
ТехнологииАппаратное обеспечение и киберфизические системы3D, графика и motion-дизайнMol*

Mol*

Pause

Экспертиза РАН

Logo-ran-black.png
Проведена экспертиза
Российской академией наук
Подробнее
Aprove.svg

Экспертиза РАН

Arrow-Right.png
Logo-ran.png
Проведена экспертиза
Российской академией наук
Подробнее

Mol* — веб-ориентированный программный инструментарий с открытым исходным кодом для анализа и визуализации макромолекулярных структур[2].

Общие сведения
Mol*
Тип моделирование молекул
Написана на TypeScript
Интерфейс графический (фреймворк React)
Движок WebGL
Операционная система кроссплатформенность
Последняя версия
Репозиторий github.com/molstar/molst…
Лицензия MIT
Сайт molstar.org

Функционал

Разрабатывается как совместная инициатива RCSB PDB и PDBe, основанная на обозревателях NGL (разработан RCSB PDB) и LiteMol (разработан PDBe). Программа для интерактивного 3D-просмотра макромолекулярных структур, Mol* Viewer, опубликована в 2021 году[3]. Mol* Viewer (обычно обозначается просто Mol*) доступен как отдельное приложение, а также интегрирован в ряд научных инструментов и баз данных[4]. К наиболее известным внедрениям относятся сайты PDBe, RCSB PDB и база данных AlphaFold, где Mol* используется для отображения каждой структуры на её отдельной странице[5]. В 2019 году Mol* заменил интегрированные ранее в RCSB PDB и PDBe обозреватели NGL и LiteMol[6].

Исходный код Mol*, включая Mol* Viewer, размещён на GitHub под лицензией MIT и включает модули для получения данных о макромолекулярных структурах из общедоступных баз, их сжатия, хранения и визуализации[7]. Для поддержки работы с большими структурами реализована поддержка формата BinaryCIF и встроенные средства декомпрессии; для веб-разработки используется TypeScript, для аппаратного ускорения 3D-графики — WebGL[3]. Mol* придерживается стандартов открытой веб-платформы и использует фреймворк React[3].

Примечания

  1. ↑ Release 4.18.0 — 2025.
  2. ↑ Mol* (англ.). molstar.org. Дата обращения: 28 мая 2025.
  3. ↑ 1 2 3 Sehnal, David; Bittrich, Sebastian; Deshpande, Mandar; Свободова, Радка; Berka, Karel; Bazgier, Václav; Velankar, Sameer; Burley, Stephen K.; Koča, Jaroslav; Rose, Alexander S. (2021-07-02). “Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures”. Nucleic Acids Research. 49 (W1): W431—W437. DOI:10.1093/nar/gkab314. ISSN 1362-4962. PMC 8262734. PMID 33956157.
  4. ↑ Integrations — Mol* Viewer Documentation. molstar.org. Дата обращения: 28 мая 2025. Архивировано 17 июня 2025 года.
  5. ↑ Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures (амер. англ.). www.rcsb.org. Дата обращения: 28 мая 2025. Архивировано 24 сентября 2022 года.
  6. ↑ Представляем Mol*: быстрый, интерактивный 3D-визуализатор прямо в вашем браузере на RCSB PDB и PDBe. www.ebi.ac.uk. Дата обращения: 28 мая 2025. Архивировано 20 октября 2022 года.
  7. ↑ Sehnal, David; Bittrich, Sebastian; Deshpande, Mandar; Свободова, Радка; Berka, Karel; Bazgier, Václav; Velankar, Sameer; Burley, Stephen K.; Koča, Jaroslav (2021-07-02). “Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures”. Nucleic Acids Research. 49 (W1): W431—W437. DOI:10.1093/nar/gkab314. PMC 8262734. PMID 33956157. Дата обращения 2025-05-28.

Категории

Pause