Материал из РУВИКИ — свободной энциклопедии

MCM6

MCM6
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2KLQ, 2LE8

Идентификаторы
ПсевдонимыMCM6, MCG40308, Mis5, P105MCM, minichromosome maintenance complex component 6
Внешние IDOMIM: 601806 MGI: 1298227 HomoloGene: 4322 GeneCards: MCM6
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме MCM6
Расположение в геноме MCM6
Локус2q21.3Начало135,839,626 bp[1]
Конец135,876,443 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме MCM6
Расположение в геноме MCM6
Локус1 E3|1 55.8 cMНачало128,259,327 bp[2]
Конец128,287,401 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
PBB GE MCM6 201930 at fs.png
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005915

NM_008567
NM_001313695

RefSeq (белок)

NP_005906

NP_001300624
NP_032593

Локус (UCSC)Chr 2: 135.84 – 135.88 MbChr 1: 128.26 – 128.29 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Репликативный фактор MCM6 — белок, который кодируется человеческим геном MCM6.[5] MCM6 это один из высококонсервативных белков группы MCM, необходимых для стадии инициации репликации генома эукариот.

Группа белков MCM6 содержит MCM6, MCM2, 4 и 7, которые обладают ДНК-геликазной активностью и могут катализировать реакцию плавления ДНК. Гексамерный белковый комплекс MCM — это ключевой компонент сборки предшественника репликативного комплекса и может быть включен в формирование репликативной вилки и связывать другие белки репликации ДНК. Фосфорилирование комплекса CDC2-киназой уменьшает геликазную активность, что приводит к предположению о роли в регуляции процесса репликации ДНК[6]. Mcm6 аффинно связывается с белком Cdt1 определенными азотистыми основаниями. Замены в этом районе приводят к прекращению связывания белка Cdt1 и белков Mcm2-7 для формирования репликативного комплекса[7].

MCM6 ген проявляет очень высокий уровень экспрессии. Ген содержит 18 интронов, Есть два варианта альтернативного сплайсинга. Транскипты, по всей видимости, различаются длинной 3' конца, наличием или отсутствием 2 экзонов и общими экзонами на двух границах. В результате альтернативного сплайсинга может образовываться 3 различных изоформы белка.

MCM6 имеет 2 регуляторных района гена LCT, кодирующего фермент лактазу, локализованный на двух интронах приблизительно 14 тыс. н.о. (-13910) и 22 тыс. н.о. (-22018) выше гена LCT[8]. В частности (-13910) область имеет энхансерный элемент, приводящий к различной активации транскрипции промотора гена LCT[9]. Мутации в этой области ассоциированы с непереносимостью лактозы во взрослом возрасте.[8][10]

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000076003 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026355 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Clare B. Harvey, Yangxi Wang, Dalila Darmoul, Alan Phillips, Ned Mantei. Characterisation of a human homologue of a yeast cell division cycle gene, MCM6, located adjacent to the 5′ end of the lactase gene on chromosome 2q21 (англ.) // FEBS Letters. — 1996-12-02. — Vol. 398, iss. 2-3. — P. 135–140. — ISSN 1873-3468. — doi:10.1016/S0014-5793(96)01189-1.
  6. MCM6 minichromosome maintenance complex component 6.
  7. Zhun Wei, Changdong Liu, Xing Wu, Naining Xu, Bo Zhou. Characterization and Structure Determination of the Cdt1 Binding Domain of Human Minichromosome Maintenance (Mcm) 6 // The Journal of Biological Chemistry. — 2010-04-23. — Т. 285, вып. 17. — С. 12469–12473. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.C109.094599.
  8. 1 2 Nabil Sabri Enattah, Timo Sahi, Erkki Savilahti, Joseph D. Terwilliger, Leena Peltonen. Identification of a variant associated with adult-type hypolactasia // Nature Genetics. — 2002-02-01. — Т. 30, вып. 2. — С. 233–237. — ISSN 1061-4036. — doi:10.1038/ng826. PMID 11788828
  9. Lynne C. Olds, Eric Sibley. Lactase persistence DNA variant enhances lactase promoter activity in vitro: functional role as a cis regulatory element // Human Molecular Genetics. — 2003-09-15. — Т. 12, вып. 18. — С. 2333–2340. — ISSN 0964-6906. — doi:10.1093/hmg/ddg244.
  10. Rejane Mattar, Daniel Ferraz de Campos Mazo, and Flair José Carrilho. Lactose intolerance: diagnosis, genetic, and clinical factors (англ.) // Clin Exp Gastroenterol.. — 2012. — Iss. 5. — P. 113–121. — doi:10.2147/CEG.S32368. — PMID PMC3401057.