CDK1
Циклин-зависимая киназа также известная как CDK1 или гомолог белка CDC2 (у делящихся дрожжей Schizosaccharomyces pombe) — высококонсервативный белок, который функционирует как серин/треониновая протеинкиназа и играет ключевую роль в регуляции клеточного цикла[1].
Циклин-зависимая киназа изучалась на почкующихся дрожжах S. cerevisiae и делящихся дрожжах S. pombe, у которых она кодируется генами cdc28 и cdc2 соответственно[2]. В комплексе с циклинами CDK1 фосфорилирует множество белков-мишеней (в почкующихся дрожжах идентифицировано более 75); фосфорилирование этих белков приводит к продолжению продвижения по фазам клеточного цикла[3].
Структура
CDK1 — это высококонсервативный небольшой белок (примерно 34 килодальтон). Человеческий гомолог CDK1 имеет около 63 % сходства с аминокислотной последовательностью аналогичного белка дрожжей. Более того, человеческий CDK1 способен восстанавливать функцию делящихся дрожжей с мутацией в гене белка CDC2[4][5]. CDK1 в основном состоит из каталитического домена протеинкиназы, который имеется у других протеинкиназ. Как и другие киназы, CDK1 содержит каталитическую щель для связывания АТФ. Субстраты CDK1 связываются у входа в щель, а остатки CDK1 катализируют ковалентное присоединение γ-фосфата к кислороду гидроксильной группы серина/треонина субстрата.
Помимо этого каталитического ядра CDK1, как и другие циклин-зависимые киназы, содержит T-петлю, которая при отсутствии связанного с CDK1 циклина препятствует связыванию субстрата с активным центром CDK1. CDK1 также содержит PSTAIRE-спираль, которая при связыванииCDK1 с циклином перемещается и реорганизует активный центр, способствуя киназной активности CDK1[6].
Функции
Когда CDK1 связана с циклинами, её фосфорилирование приводит к продвижению по фазам клеточного цикла. Активность CDK1 лучше всего изучена в S. cerevisiae, поэтому здесь описана активность CDK1 у S. cerevisiae.
В почкующихся дрожжах вход в клеточный цикл контролируется двумя регуляторными комплексами: SBF (фактор связывания SCB) и MBF (фактор связывания MCB). Эти два комплекса контролируют транскрипцию генов G1/S; однако обычно они неактивны. SBF ингибируется белком Whi5; при фосфорилировании Cln3-Cdk1 белок Whi5 выбрасывается из ядра, что позволяет начать транскрипцию G1/S-регулона, включающего G1/S-циклины Cln1,2[7]. Активность G1/S-циклин-CDK1 приводит к подготовке к входу в S-фазу (например, дупликации центромер или полярного тельца веретена), и повышению уровня S-циклинов (Clb5,6 в S. cerevisiae). Комплексы Clb5,6-CDK1 напрямую приводят к инициации начала репликации[8]; однако они ингибируются Sic1, предотвращая преждевременный вход в S-фазу.
Активность комплексов Cln1,2 и/или Clb5,6-CDK1 приводит к резкому снижению уровня Sic1, что запускает согласованный вход в S-фазу. Фосфорилирование M-циклинами (например, Clb1, 2, 3 и 4) в комплексе с CDK1 запускает сборку веретена деления и выравнивание сестринских хроматид. Фосфорилирование CDK1 также приводит к активации убиквитин-протеин-лигазы APCCdc20, активация которой запускает сегрегацию хроматид и, кроме того, деградацию M-фазных циклинов. Разрушение M-циклинов приводит к финальным событиям митоза (например, разборке веретена деления, выходу из митоза).
Регуляция
Учитывая ключевую роль CDK1 в прохождении фаз клеточного цикла, её работа строго регулируется. Наиболее очевидный способ регуляции работы CDK1 — связывание с циклинами. Связывание с циклином изменяет доступ к активному центру CDK1, позволяя активировать её; кроме того, циклины задают специфичность активности CDK1. По крайней мере некоторые циклины содержат гидрофобный участок, который может напрямую взаимодействовать с субстратами, определяя специфичность мишеней[9]. Более того, циклины могут направлять CDK1 в определённые субклеточные компартменты.
Помимо регуляции циклинами, CDK1 регулируется фосфорилированием. Консервативный тирозин (Tyr15 у человека) приводит к ингибированию CDK1; предполагается, что это фосфорилирование изменяет ориентацию АТФ, препятствуя эффективной киназной активности. В S. pombe, например, незавершённый синтез ДНК может стабилизировать это фосфорилирование, предотвращая продолжение митоза[10]. Белок Wee1, консервативный у всех эукариот, фосфорилирует Tyr15, тогда как белки семейства Cdc25 являются фосфатазами, противодействующими этой активности. Баланс между ними, как считается, помогает регулировать продвижение по фазам клеточного цикла. Wee1 контролируется Cdr1, Cdr2 и Pom1.
Комплексы CDK1-циклин также регулируются прямым связыванием с ингибиторами CDK (CKI). Одним из таких белков является Sic1. Sic1 — стехиометрический ингибитор, который напрямую связывается с комплексами Clb5,6-CDK1. Множественное фосфорилирование Sic1 комплексами CDK1-Cln1/2, как считается, синхронизирует убиквитинирование и разрушение Sic1, а следовательно, и время входа в S-фазу. Только после преодоления ингибирования Sic1 может проявиться активность Clb5,6 и начаться инициация S-фазы.
Взаимодействия
Примечания
Литература
- Draetta G, Eckstein J (April 1997). “Cdc25 protein phosphatases in cell proliferation”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Reviews on Cancer. 1332 (2): M53—M63. DOI:10.1016/S0304-419X(96)00049-2. PMID 9141461.
- Kino T, Pavlakis GN (April 2004). “Partner molecules of accessory protein Vpr of the human immunodeficiency virus type 1”. DNA and Cell Biology. 23 (4): 193—205. DOI:10.1089/104454904773819789. PMID 15142377.
- Kino T, Chrousos GP (June 2004). “Human immunodeficiency virus type-1 accessory protein Vpr: a causative agent of the AIDS-related insulin resistance/lipodystrophy syndrome?”. Annals of the New York Academy of Sciences. 1024 (1): 153—167. Bibcode:2004NYASA1024..153K. DOI:10.1196/annals.1321.013. PMID 15265780. S2CID 23655886.
- Zhao LJ, Zhu H (December 2004). “Structure and function of HIV-1 auxiliary regulatory protein Vpr: novel clues to drug design”. Current Drug Targets. Immune, Endocrine and Metabolic Disorders. 4 (4): 265—275. DOI:10.2174/1568008043339668. PMID 15578977.
- Le Rouzic E, Benichou S (February 2005). “The Vpr protein from HIV-1: distinct roles along the viral life cycle”. Retrovirology. 2. DOI:10.1186/1742-4690-2-11. PMC 554975. PMID 15725353. Неизвестный параметр
|article-number=(справка) - Zhao RY, Elder RT (March 2005). “Viral infections and cell cycle G2/M regulation”. Cell Research. 15 (3): 143—149. DOI:10.1038/sj.cr.7290279. PMID 15780175.
- Zhao RY, Bukrinsky M, Elder RT (April 2005). “HIV-1 viral protein R (Vpr) & host cellular responses”. The Indian Journal of Medical Research. 121 (4): 270—286. PMID 15817944.
- Kaldis P, Aleem E (November 2005). “Cell cycle sibling rivalry: Cdc2 vs. Cdk2”. Cell Cycle. 4 (11): 1491—1494. DOI:10.4161/cc.4.11.2124. PMID 16258277.
- Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). “Roles of HIV-1 auxiliary proteins in viral pathogenesis and host-pathogen interactions”. Cell Research. 15 (11—12): 923—934. DOI:10.1038/sj.cr.7290370. PMID 16354571.
- Rietbrock N, Keller F (July 1977). “[Biologic availability and "1st pass" effect of drugs]”. Fortschritte der Medizin. 95 (28): 1765—6, 1774—80. PMID 914146.
- Azzi L, Meijer L, Reed SI, Pidikiti R, Tung HY (February 1992). “Interaction between the cell-cycle-control proteins p34cdc2 and p9CKShs2. Evidence for two cooperative binding domains in p9CKShs2”. European Journal of Biochemistry. 203 (3): 353—360. DOI:10.1111/j.1432-1033.1992.tb16557.x. PMID 1310466.
- Dutta A, Stillman B (June 1992). “cdc2 family kinases phosphorylate a human cell DNA replication factor, RPA, and activate DNA replication”. The EMBO Journal. 11 (6): 2189—2199. DOI:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05278.x. PMC 556686. PMID 1318195.
- Koff A, Giordano A, Desai D, Yamashita K, Harper JW, Elledge S, Nishimoto T, Morgan DO, Franza BR, Roberts JM (September 1992). “Formation and activation of a cyclin E-cdk2 complex during the G1 phase of the human cell cycle”. Science. 257 (5077): 1689—1694. Bibcode:1992Sci...257.1689K. DOI:10.1126/science.1388288. PMID 1388288.
- Russo GL, Vandenberg MT, Yu IJ, Bae YS, Franza BR, Marshak DR (October 1992). “Casein kinase II phosphorylates p34cdc2 kinase in G1 phase of the HeLa cell division cycle”. The Journal of Biological Chemistry. 267 (28): 20317—20325. DOI:10.1016/S0021-9258(19)88704-5. PMID 1400350.
- Rubinfeld B, Crosier WJ, Albert I, Conroy L, Clark R, McCormick F, Polakis P (October 1992). “Localization of the rap1GAP catalytic domain and sites of phosphorylation by mutational analysis”. Molecular and Cellular Biology. 12 (10): 4634—4642. DOI:10.1128/MCB.12.10.4634. PMC 360390. PMID 1406653.
- van der Sluijs P, Hull M, Huber LA, Mâle P, Goud B, Mellman I (December 1992). “Reversible phosphorylation--dephosphorylation determines the localization of rab4 during the cell cycle”. The EMBO Journal. 11 (12): 4379—4389. DOI:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05538.x. PMC 557012. PMID 1425574.
- Seth A, Alvarez E, Gupta S, Davis RJ (December 1991). “A phosphorylation site located in the NH2-terminal domain of c-Myc increases transactivation of gene expression”. The Journal of Biological Chemistry. 266 (35): 23521—23524. DOI:10.1016/S0021-9258(18)54312-X. PMID 1748630.
- Lees JA, Buchkovich KJ, Marshak DR, Anderson CW, Harlow E (December 1991). “The retinoblastoma protein is phosphorylated on multiple sites by human cdc2”. The EMBO Journal. 10 (13): 4279—4290. DOI:10.1002/j.1460-2075.1991.tb05006.x. PMC 453181. PMID 1756735.
- Nazarenko SA, Ostroverhova NV, Spurr NK (September 1991). “Regional assignment of the human cell cycle control gene CDC2 to chromosome 10q21 by in situ hybridization”. Human Genetics. 87 (5): 621—622. DOI:10.1007/BF00209025. PMID 1916766. S2CID 25673088.
- Nissen MS, Langan TA, Reeves R (October 1991). “Phosphorylation by cdc2 kinase modulates DNA binding activity of high mobility group I nonhistone chromatin protein”. The Journal of Biological Chemistry. 266 (30): 19945—19952. DOI:10.1016/S0021-9258(18)54874-2. PMID 1939057.