CDK1

Циклин-зависимая киназа также известная как CDK1 или гомолог белка CDC2 (у делящихся дрожжей Schizosaccharomyces pombe) — высококонсервативный белок, который функционирует как серин/треониновая протеинкиназа и играет ключевую роль в регуляции клеточного цикла[1].

Циклин-зависимая киназа изучалась на почкующихся дрожжах S. cerevisiae и делящихся дрожжах S. pombe, у которых она кодируется генами cdc28 и cdc2 соответственно[2]. В комплексе с циклинами CDK1 фосфорилирует множество белков-мишеней (в почкующихся дрожжах идентифицировано более 75); фосфорилирование этих белков приводит к продолжению продвижения по фазам клеточного цикла[3].

Общие сведения
CDK1
Обозначения
UniProt P06493

Структура

undefined

CDK1 — это высококонсервативный небольшой белок (примерно 34 килодальтон). Человеческий гомолог CDK1 имеет около 63 % сходства с аминокислотной последовательностью аналогичного белка дрожжей. Более того, человеческий CDK1 способен восстанавливать функцию делящихся дрожжей с мутацией в гене белка CDC2[4][5]. CDK1 в основном состоит из каталитического домена протеинкиназы, который имеется у других протеинкиназ. Как и другие киназы, CDK1 содержит каталитическую щель для связывания АТФ. Субстраты CDK1 связываются у входа в щель, а остатки CDK1 катализируют ковалентное присоединение γ-фосфата к кислороду гидроксильной группы серина/треонина субстрата.

Помимо этого каталитического ядра CDK1, как и другие циклин-зависимые киназы, содержит T-петлю, которая при отсутствии связанного с CDK1 циклина препятствует связыванию субстрата с активным центром CDK1. CDK1 также содержит PSTAIRE-спираль, которая при связыванииCDK1 с циклином перемещается и реорганизует активный центр, способствуя киназной активности CDK1[6].

Функции

undefined

Когда CDK1 связана с циклинами, её фосфорилирование приводит к продвижению по фазам клеточного цикла. Активность CDK1 лучше всего изучена в S. cerevisiae, поэтому здесь описана активность CDK1 у S. cerevisiae.

В почкующихся дрожжах вход в клеточный цикл контролируется двумя регуляторными комплексами: SBF (фактор связывания SCB) и MBF (фактор связывания MCB). Эти два комплекса контролируют транскрипцию генов G1/S; однако обычно они неактивны. SBF ингибируется белком Whi5; при фосфорилировании Cln3-Cdk1 белок Whi5 выбрасывается из ядра, что позволяет начать транскрипцию G1/S-регулона, включающего G1/S-циклины Cln1,2[7]. Активность G1/S-циклин-CDK1 приводит к подготовке к входу в S-фазу (например, дупликации центромер или полярного тельца веретена), и повышению уровня S-циклинов (Clb5,6 в S. cerevisiae). Комплексы Clb5,6-CDK1 напрямую приводят к инициации начала репликации[8]; однако они ингибируются Sic1, предотвращая преждевременный вход в S-фазу.

Активность комплексов Cln1,2 и/или Clb5,6-CDK1 приводит к резкому снижению уровня Sic1, что запускает согласованный вход в S-фазу. Фосфорилирование M-циклинами (например, Clb1, 2, 3 и 4) в комплексе с CDK1 запускает сборку веретена деления и выравнивание сестринских хроматид. Фосфорилирование CDK1 также приводит к активации убиквитин-протеин-лигазы APCCdc20, активация которой запускает сегрегацию хроматид и, кроме того, деградацию M-фазных циклинов. Разрушение M-циклинов приводит к финальным событиям митоза (например, разборке веретена деления, выходу из митоза).

Регуляция

Учитывая ключевую роль CDK1 в прохождении фаз клеточного цикла, её работа строго регулируется. Наиболее очевидный способ регуляции работы CDK1 — связывание с циклинами. Связывание с циклином изменяет доступ к активному центру CDK1, позволяя активировать её; кроме того, циклины задают специфичность активности CDK1. По крайней мере некоторые циклины содержат гидрофобный участок, который может напрямую взаимодействовать с субстратами, определяя специфичность мишеней[9]. Более того, циклины могут направлять CDK1 в определённые субклеточные компартменты.

Помимо регуляции циклинами, CDK1 регулируется фосфорилированием. Консервативный тирозин (Tyr15 у человека) приводит к ингибированию CDK1; предполагается, что это фосфорилирование изменяет ориентацию АТФ, препятствуя эффективной киназной активности. В S. pombe, например, незавершённый синтез ДНК может стабилизировать это фосфорилирование, предотвращая продолжение митоза[10]. Белок Wee1, консервативный у всех эукариот, фосфорилирует Tyr15, тогда как белки семейства Cdc25 являются фосфатазами, противодействующими этой активности. Баланс между ними, как считается, помогает регулировать продвижение по фазам клеточного цикла. Wee1 контролируется Cdr1, Cdr2 и Pom1.

Комплексы CDK1-циклин также регулируются прямым связыванием с ингибиторами CDK (CKI). Одним из таких белков является Sic1. Sic1 — стехиометрический ингибитор, который напрямую связывается с комплексами Clb5,6-CDK1. Множественное фосфорилирование Sic1 комплексами CDK1-Cln1/2, как считается, синхронизирует убиквитинирование и разрушение Sic1, а следовательно, и время входа в S-фазу. Только после преодоления ингибирования Sic1 может проявиться активность Clb5,6 и начаться инициация S-фазы.

Взаимодействия

Примечания

  1. 1 2 Morgan, David L. The cell cycle: principles of control. — London : New Science Press, 2007. — P. 30–31. — ISBN 978-0-19-920610-0.
  2. Nasmyth K (April 1993). “Control of the yeast cell cycle by the Cdc28 protein kinase”. Current Opinion in Cell Biology. 5 (2): 166—179. DOI:10.1016/0955-0674(93)90099-C. PMID 8507488.
  3. Enserink JM, Kolodner RD (May 2010). “An overview of Cdk1-controlled targets and processes”. Cell Division. 5 (11): 11. DOI:10.1186/1747-1028-5-11. PMC 2876151. PMID 20465793.
  4. Lee MG, Nurse P (Jun 1987). “Complementation used to clone a human homologue of the fission yeast cell cycle control gene cdc2”. Nature. 327 (6117): 31—35. Bibcode:1987Natur.327...31L. DOI:10.1038/327031a0. PMID 3553962. S2CID 4300190.
  5. De Bondt HL, Rosenblatt J, Jancarik J, Jones HD, Morgan DO, Kim SH (June 1993). “Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2”. Nature. 363 (6430): 595—602. Bibcode:1993Natur.363..595D. DOI:10.1038/363595a0. PMID 8510751. S2CID 4354370.
  6. Jeffrey PD, Russo AA, Polyak K, Gibbs E, Hurwitz J, Massagué J, Pavletich NP (July 1995). “Mechanism of CDK activation revealed by the structure of a cyclinA-CDK2 complex”. Nature. 376 (6538): 313—320. Bibcode:1995Natur.376..313J. DOI:10.1038/376313a0. PMID 7630397. S2CID 4361179.
  7. Skotheim JM, Di Talia S, Siggia ED, Cross FR (July 2008). “Positive feedback of G1 cyclins ensures coherent cell cycle entry”. Nature. 454 (7202): 291—296. Bibcode:2008Natur.454..291S. DOI:10.1038/nature07118. PMC 2606905. PMID 18633409.
  8. Cross FR, Yuste-Rojas M, Gray S, Jacobson MD (July 1999). “Specialization and targeting of B-type cyclins”. Molecular Cell. 4 (1): 11—19. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80183-5. PMID 10445023.
  9. Brown NR, Noble ME, Endicott JA, Johnson LN (November 1999). “The structural basis for specificity of substrate and recruitment peptides for cyclin-dependent kinases”. Nature Cell Biology. 1 (7): 438—443. DOI:10.1038/15674. PMID 10559988. S2CID 17988582.
  10. Elledge SJ (December 1996). “Cell cycle checkpoints: preventing an identity crisis”. Science. 274 (5293): 1664—1672. Bibcode:1996Sci...274.1664E. DOI:10.1126/science.274.5293.1664. PMID 8939848. S2CID 39235426.
  11. Pathan N, Aime-Sempe C, Kitada S, Basu A, Haldar S, Reed JC (2001). “Microtubule-targeting drugs induce bcl-2 phosphorylation and association with Pin1”. Neoplasia. 3 (6): 550—559. DOI:10.1038/sj.neo.7900213. PMC 1506558. PMID 11774038.
  12. Pathan N, Aime-Sempe C, Kitada S, Haldar S, Reed JC (2001). “Microtubule-targeting drugs induce Bcl-2 phosphorylation and association with Pin1”. Neoplasia. 3 (1): 70—79. DOI:10.1038/sj.neo.7900131. PMC 1505024. PMID 11326318.
  13. 1 2 Shanahan F, Seghezzi W, Parry D, Mahony D, Lees E (February 1999). “Cyclin E associates with BAF155 and BRG1, components of the mammalian SWI-SNF complex, and alters the ability of BRG1 to induce growth arrest”. Molecular and Cellular Biology. 19 (2): 1460—1469. DOI:10.1128/mcb.19.2.1460. PMC 116074. PMID 9891079.
  14. Pines J, Hunter T (September 1989). “Isolation of a human cyclin cDNA: evidence for cyclin mRNA and protein regulation in the cell cycle and for interaction with p34cdc2”. Cell. 58 (5): 833—846. DOI:10.1016/0092-8674(89)90936-7. PMID 2570636. S2CID 20336733.
  15. Kong M, Barnes EA, Ollendorff V, Donoghue DJ (March 2000). “Cyclin F regulates the nuclear localization of cyclin B1 through a cyclin-cyclin interaction”. The EMBO Journal. 19 (6): 1378—1388. DOI:10.1093/emboj/19.6.1378. PMC 305678. PMID 10716937.
  16. Koff A, Giordano A, Desai D, Yamashita K, Harper JW, Elledge S, Nishimoto T, Morgan DO, Franza BR, Roberts JM (September 1992). “Formation and activation of a cyclin E-cdk2 complex during the G1 phase of the human cell cycle”. Science. 257 (5077): 1689—1694. Bibcode:1992Sci...257.1689K. DOI:10.1126/science.1388288. PMID 1388288.
  17. Hannon GJ, Casso D, Beach D (March 1994). “KAP: a dual specificity phosphatase that interacts with cyclin-dependent kinases”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (5): 1731—1735. Bibcode:1994PNAS...91.1731H. DOI:10.1073/pnas.91.5.1731. PMC 43237. PMID 8127873.
  18. Gyuris J, Golemis E, Chertkov H, Brent R (November 1993). “Cdi1, a human G1 and S phase protein phosphatase that associates with Cdk2”. Cell. 75 (4): 791—803. DOI:10.1016/0092-8674(93)90498-F. PMID 8242750.
  19. He J, Xu J, Xu XX, Hall RA (July 2003). “Cell cycle-dependent phosphorylation of Disabled-2 by cdc2”. Oncogene. 22 (29): 4524—4530. DOI:10.1038/sj.onc.1206767. PMID 12881709.
  20. Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, Zhi Y, Herterich S, Hoehn H, Gross HJ, Joenje H, Hoatlin ME, Mathew CG, Huber PA (October 2003). “Yeast two-hybrid screens imply involvement of Fanconi anemia proteins in transcription regulation, cell signaling, oxidative metabolism, and cellular transport”. Experimental Cell Research. 289 (2): 211—221. DOI:10.1016/S0014-4827(03)00261-1. PMID 14499622.
  21. Kupfer GM, Yamashita T, Naf D, Suliman A, Asano S, D'Andrea AD (August 1997). “The Fanconi anemia polypeptide, FAC, binds to the cyclin-dependent kinase, cdc2”. Blood. 90 (3): 1047—1054. DOI:10.1182/blood.V90.3.1047. PMID 9242535.
  22. Zhan Q, Antinore MJ, Wang XW, Carrier F, Smith ML, Harris CC, Fornace AJ (May 1999). “Association with Cdc2 and inhibition of Cdc2/Cyclin B1 kinase activity by the p53-regulated protein Gadd45”. Oncogene. 18 (18): 2892—2900. DOI:10.1038/sj.onc.1202667. PMID 10362260.
  23. Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Dong X, Zhao H, Fan F, Colchagie AB, Blanck P, Roller PP, Fornace AJ, Zhan Q (June 2000). “The GADD45 inhibition of Cdc2 kinase correlates with GADD45-mediated growth suppression”. The Journal of Biological Chemistry. 275 (22): 16602—16608. DOI:10.1074/jbc.M000284200. PMID 10747892.
  24. Yang Q, Manicone A, Coursen JD, Linke SP, Nagashima M, Forgues M, Wang XW (November 2000). “Identification of a functional domain in a GADD45-mediated G2/M checkpoint”. The Journal of Biological Chemistry. 275 (47): 36892—36898. DOI:10.1074/jbc.M005319200. PMID 10973963.
  25. Vairapandi M, Balliet AG, Hoffman B, Liebermann DA (September 2002). “GADD45b and GADD45g are cdc2/cyclinB1 kinase inhibitors with a role in S and G2/M cell cycle checkpoints induced by genotoxic stress”. Journal of Cellular Physiology. 192 (3): 327—338. DOI:10.1002/jcp.10140. PMID 12124778. S2CID 19138273.
  26. Tao W, Zhang S, Turenchalk GS, Stewart RA, St John MA, Chen W, Xu T (February 1999). “Human homologue of the Drosophila melanogaster lats tumour suppressor modulates CDC2 activity”. Nature Genetics. 21 (2): 177—181. DOI:10.1038/5960. PMID 9988268. S2CID 32090556.
  27. Kharbanda S, Yuan ZM, Rubin E, Weichselbaum R, Kufe D (August 1994). “Activation of Src-like p56/p53lyn tyrosine kinase by ionizing radiation”. The Journal of Biological Chemistry. 269 (32): 20739—20743. DOI:10.1016/S0021-9258(17)32054-9. PMID 8051175.
  28. Pathan NI, Geahlen RL, Harrison ML (November 1996). “The protein-tyrosine kinase Lck associates with and is phosphorylated by Cdc2”. The Journal of Biological Chemistry. 271 (44): 27517—27523. DOI:10.1074/jbc.271.44.27517. PMID 8910336.
  29. Luciani MG, Hutchins JR, Zheleva D, Hupp TR (July 2000). “The C-terminal regulatory domain of p53 contains a functional docking site for cyclin A”. Journal of Molecular Biology. 300 (3): 503—518. DOI:10.1006/jmbi.2000.3830. PMID 10884347.
  30. Ababneh M, Götz C, Montenarh M (May 2001). “Downregulation of the cdc2/cyclin B protein kinase activity by binding of p53 to p34(cdc2)”. Biochemical and Biophysical Research Communications. 283 (2): 507—512. DOI:10.1006/bbrc.2001.4792. PMID 11327730.
  31. Tan F, Lu L, Cai Y, Wang J, Xie Y, Wang L, Gong Y, Xu BE, Wu J, Luo Y, Qiang B, Yuan J, Sun X, Peng X (July 2008). “Proteomic analysis of ubiquitinated proteins in normal hepatocyte cell line Chang liver cells”. Proteomics. 8 (14): 2885—2896. DOI:10.1002/pmic.200700887. PMID 18655026. S2CID 25586938.

Литература