АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

AIM2

AIM2 (от англ. absent in melanoma 2) — белок, участвует в регуляции иммунного ответа. Продукт гена человека AIM2.[5][6]

Белок входит в особый тип инфламмосом, распознающих инородную бактериальную или вирусную ДНК.[7]

Общие сведения
AIM2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3RN2, 3RN5, 3VD8, 4O7Q

Идентификаторы
ПсевдонимыAIM2, PYHIN4, absent in melanoma 2
Внешние IDOMIM: 604578 MGI: 2686159 HomoloGene: 83226 GeneCards: AIM2
Расположение гена (человек)
Хр.1-я хромосома человека[1]
Локус1q23.1|1q23.1-q23.2Начало159,061,599 bp[1]
Конец159,187,843 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.1-я хромосома мыши[2]
Локус1|1 H3Начало173,350,879 bp[2]
Конец173,466,040 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
    н/д
Наибольшая экспрессия в
  • left colon

  • medial geniculate nucleus

  • median eminence

  • dorsomedial hypothalamic nucleus
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

9447

383619

Ensembl

ENSG00000163568

ENSMUSG00000037860

UniProt

O14862

Q91VJ1

RefSeq (мРНК)

NM_004833
NM_001348247

NM_001013779

RefSeq (белок)

NP_004824
NP_001335176

NP_001013801

Локус (UCSC)Chr 1: 159.06 – 159.19 MbChr 1: 173.35 – 173.47 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функции

Белок входит в семейство цитокинов Ifi202/IFI16, содержащих HIN-200 домен. Экспрессия AIM2 индуцируется интерфероном-гамма.[6]

AIM2 способен к образования особого типа инфламмасом, называемые также ДНК-инфламмасомы по их способности распознавать инородную ДНК за счёт HIN200 домена, который связывает ДНК, и PYD домена, который рекрутирует адаптерный белок ASC, необходимый для формирования инфламмасомы. Олигомеризация комплекса происходит в присутствии бактериальной либо вирусной ДНК, а также собственной повреждённой ДНК. Последнее приводит в результате к аутоиммунной реакции. ASC содержит CARD домен (англ. caspase activation and recruitment domain), который, в свою очередь, рекрутирует прокаспазу-1, что приводит к самоактивации каспазы-1. Активированная каспаза-1 процессирует в активную форму воспалительные цитокины интелейкин-1 бета и интерлейкин-18.[7]

Структура

Белок AIM2 состоит из 343 аминокислот. Содержит N-терминальный пириновый домен DAPIN (участок 1-87) и C-терминальный HIN-200 домен (участок 138-337), который включает 2 фрагмента, способных связывать олигонуклеотиды.[8]

Клиническое значение

Повышенный уровень белка AIM2 обнаружен в коже больных псориазом.[9]

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163568 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037860 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ DeYoung K. L., Ray M. E., Su Y. A., Anzick S. L., Johnstone R. W., Trapani J. A., Meltzer P. S., Trent J. M. Cloning a novel member of the human interferon-inducible gene family associated with control of tumorigenicity in a model of human melanoma (англ.) // Oncogene (журнал) : journal. — 1997. — August (vol. 15, no. 4). — P. 453—457. — doi:10.1038/sj.onc.1201206. — PMID 9242382.
  6. ↑ 1 2 Entrez Gene: AIM2 absent in melanoma 2. Архивировано 8 марта 2010 года.
  7. ↑ 1 2 Schroder K., Tschopp J. The inflammasomes (англ.) // Cell. — Cell Press, 2010. — March (vol. 140, no. 6). — P. 821—832. — doi:10.1016/j.cell.2010.01.040. — PMID 20303873.
  8. ↑ Fernandes-Alnemri T., Yu J. W., Datta P., Wu J., Alnemri E. S. AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA (англ.) // Nature : journal. — 2009. — March (vol. 458, no. 7237). — P. 509—513. — doi:10.1038/nature07710. — PMID 19158676. — PMC 2862225.
  9. ↑ Dombrowski, Y; Peric, M., Koglin, S., Kammerbauer, C., Göß, C., Anz, D., Simanski, M., Gläser, R., Harder, J., Hornung, V., Gallo, R. L., Ruzicka, T., Besch, R., Schauber, J. Cytosolic DNA Triggers Inflammasome Activation in Keratinocytes in Psoriatic Lesions (англ.) // Science translational medicine : journal. — 2011. — 11 May (vol. 3, no. 82). — P. 82ra38—82ra38. — doi:10.1126/scitranslmed.3002001. — PMID 21562230.

Литература

  • Landolfo S., Gariglio M., Gribaudo G., Lembo D. The Ifi 200 genes: an emerging family of IFN-inducible genes (англ.) // Biochimie : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 721—728. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80025-X. — PMID 9865494.
  • Woerner SM; Kloor M; Schwitalle Y; Youmans, Hanni; Doeberitz, Magnus von Knebel; Gebert, Johannes; Dihlmann, Susanne. The putative tumor suppressor AIM2 is frequently affected by different genetic alterations in microsatellite unstable colon cancers (англ.) // Genes, Chromosomes and Cancer : journal. — 2007. — Vol. 46, no. 12. — P. 1080—1089. — doi:10.1002/gcc.20493. — PMID 17726700.
  • Gregory SG; Barlow KF; McLay KE; Kaul, R.; Swarbreck, D.; Dunham, A.; Scott, C. E.; Howe, K. L.; Woodfine, K. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
  • Chen IF; Ou-Yang F; Hung JY; Liu, JC; Wang, H; Wang, SC; Hou, MF; Hortobagyi, GN; Hung, M. C. AIM2 suppresses human breast cancer cell proliferation in vitro and mammary tumor growth in a mouse model (англ.) // Mol. Cancer Ther. : journal. — 2006. — Vol. 5, no. 1. — P. 1—7. — doi:10.1158/1535-7163.MCT-05-0310. — PMID 16432157.
  • Cresswell KS; Clarke CJ; Jackson JT; Darcy, Phillip K.; Trapani, Joseph A.; Johnstone, Ricky W. Biochemical and growth regulatory activities of the HIN-200 family member and putative tumor suppressor protein, AIM2 (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2005. — Vol. 326, no. 2. — P. 417—424. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.11.048. — PMID 15582594.
  • Liu G; Yu JS; Zeng G; Yin, Dong; Xie, Dong; Black, Keith L.; Ying, Han. AIM-2: a novel tumor antigen is expressed and presented by human glioma cells (англ.) // J. Immunother. : journal. — 2004. — Vol. 27, no. 3. — P. 220—226. — doi:10.1097/00002371-200405000-00006. — PMID 15076139.
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G. D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Choubey D., Walter S., Geng Y., Xin H. Cytoplasmic localization of the interferon-inducible protein that is encoded by the AIM2 (absent in melanoma) gene from the 200-gene family (англ.) // FEBS Letters : journal. — 2000. — Vol. 474, no. 1. — P. 38—42. — doi:10.1016/S0014-5793(00)01571-4. — PMID 10828447.

Категории