Филиппенко получил степень бакалавра по окончании Калифорнийского университета в Санта-Барбаре в 1979 году и доктора философии в астрономии по окончании Калифорнийского технологического института в 1984 году.
Его исследования направлены на сверхновые и активные галактики в оптических, ультрафиолетовых и ближних инфракрасных длинах волн. Филиппенко был членом научных проектов Supernova и HIGH-Z Supernova Search, которые занимались наблюдением за сверхновыми звёздами и ускоряющейся Вселенной. В результате было предположено существование тёмной энергии, что стало большим прорывом для науки в 1998 году[3].
Филиппенко разработал и запустил роботизированные телескопы, которые занимаются поиском сверхновых. Он также является членом Ньюкеровской группы учёных, использующей космический телескоп Хаббл для изучения сверхмассивных чёрных дыр[4][5]. Индекс цитируемости Филиппенко оценивается как наиболее высокий среди исследователей в области космической науки за период с 1996 по 2006 годы[6].
Алексей Филиппенко часто принимает участие в научно-популярном документальном телесериале «Вселенная» на телеканале History Channel, сериале «Как устроена вселенная» и множестве других подобных.
В 2006 году Филиппенко был удостоен премии Профессор года США.[8] Студенты Калифорнийского университета в Беркли признали его в качестве «Лучшего профессора» на территории кампуса девять раз.[9] Филиппенко выиграл в 2010 году премию Ричарда Эммонса за выдающиеся достижения в преподавании астрономии в колледже, выданное Тихоокеанским астрономическим обществом[10].
↑Sagan Prize Recipients (неопр.). wonderfest.org (2011 [last update]). Дата обращения: 7 августа 2013. Архивировано 6 августа 2019 года. Недоступная ссылка.