Сюняев, Шамиль Рашидович
Шами́ль Раши́дович Сюня́ев (англ. Shamil Sunyaev[1]; род. 17 января 1971, Москва) — профессор и заслуженный заведующий кафедрой вычислительной геномики (англ. Professor and Distinguished Chair of Computational Genomics), профессор медицины Гарвардской медицинской школы, руководитель исследовательской лаборатории клиники «Бригам энд Вименс» (Brigham & Women’s Hospital), ассоциированный член Объединённого института Гарвардского университета и Массачусетского технологического института. Известен как один из создателей программы PolyPhen-2, предназначенной для предсказания влияния генетических вариаций на структуру и функции белков человека[2][1].
Общие сведения
| Шамиль Рашидович Сюняев | |
|---|---|
| Shamil Sunyaev | |
| Дата рождения | 17 января 1971 (55 лет) |
| Место рождения | |
| Страна |
Россия США |
| Научная сфера | Вычислительная биология, Генетика |
| Место работы |
Гарвардская медицинская школа (Harvard Medical School), Клиника «Бригам энд Вименс» (Brigham & Women’s Hospital) |
| Образование | Институт молекулярной биологии имени В. А. Энгельгардта РАН |
| Учёная степень | кандидат физико-математических наук |
| Научный руководитель | В. Г. Туманян |
| Ученики |
Люк О'Коннор Дэниел Джордан Кори Бакаларски |
| Известен как | разработчик вычислительных методов для анализа генетических вариаций, создатель программы PolyPhen-2 |
| Награды и премии |
Победитель CLARITY Challenge (2012) Исследовательская награда консорциума IGVF |
Биография
Шамиль Сюняев родился в Москве 17 января 1971 года. Его отец — советский и российский астрофизик, академик РАН Рашид Сюняев.
В 1988 году Шамиль окончил среднюю школу и поступил в Московский Физико-технический институт. В 1994 году окончил факультет физико-химической биологии МФТИ. В этом же году поступил в аспирантуру Института молекулярной биологии имени В. А. Энгельгардта. Его научным руководителем стал В. Г. Туманян[3]. В 1997 году в Институте молекулярной биологии имени В. А. Энгельгардта РАН защитил диссертацию на соискание учёной степени кандидата физико-математических наук (эквивалентной PhD) по теме «Статистический подход к задаче распознавания пространственной укладки белковой глобулы по аминокислотной последовательности».
С 1998 по 2002 год[4] проходил постдокторантуру в Европейской молекулярно-биологической лаборатории (EMBL) под руководством Пира Борка (Peer Bork).
Затем, переехав в США, начал работу в Гарвардском университете. Стал профессором биомедицинской информатики и профессором медицины (англ. Professor and Distinguished Chair of Computational Genomics) Гарвардской медицинской школы и руководителем исследовательской лабораторией в клинике «Бригам энд Вименс» (Brigham and Women’s Hospital), а также ассоциированный член Объединённого института Гарвардского университета и Массачусетского технологического института.
Научные интересы
Основные научные интересы Ш. Сюняева относятся к созданию новых статистических и вычислительных методов в генетике, геномике и протеомике, ориентированных на исследование наследственной изменчивости генотипа человека. Его лаборатория занимается изучением механизмов мутаций, их функциональных последствий и популяционной генетики. В частности, Сюняев является одним из ключевых создателей программы PolyPhen-2 (Polymorphism Phenotyping v2), широко применяемого инструмента для предсказания влияния аминокислотных замен на структуру и функцию белков человека. Его команда также внесла вклад в понимание механизмов спонтанных мутаций в геноме человека[5]. Разработанные подходы активно используются в медицинской генетике для поиска генов, ответственных за наследственные заболевания. Лаборатория также участвует в проектах по анализу генетической изменчивости и генетике многофакторных болезней, ведёт исследования по вычислительным методам в протеомике и биологии развития.
Ш. Сюняев руководит рядом проектов, финансируемых Национальными институтами здравоохранения США.
В разное время Шамиль Сюняев был членом редакционных коллегий различных журналов, как например, American Journal of Human Genetics. В 2012 году команда под его руководством стала победителем конкурса CLARITY Challenge за лучшую интерпретацию геномных данных. Также является получателем исследовательской награды от консорциума «Влияние геномной вариации на функцию» (Impact of Genomic Variation on Function, IGVF).
Ш. Р. Сюняев — автор множества работ, опубликованных в ведущих научных изданиях мира[6]. По состоянию на ноябрь 2025 года его индекс Хирша по данным Google Scholar составлял 139[7].
Научные публикации и исследования
Шамиль Сюняев является соавтором ряда исследований, опубликованных в ведущих научных журналах и посвящённых фундаментальным аспектам мутагенеза, генетики популяций и связи генетических вариаций с заболеваниями человека.
2023 год
- В декабре в журнале Nature Genetics была опубликована статья, соавтором которой выступил Сюняев. В исследовании был выявлен ранее неизвестный мутагенный механизм: частота мутаций в генах, транскрибируемых РНК-полимеразой III, оказалась в десять раз выше, чем предсказывала базовая модель[8].
- В июне в журнале Science вышла работа, в которой Сюняев был частью большого коллектива авторов. В рамках исследования был проведён анализ генетической изменчивости у 233 видов приматов, что позволило создать ресурс для интерпретации генетических вариантов человека и оценки их патогенности[9].
- В июле в журнале Genetics была опубликована статья, посвящённая теории выборки для числа скрытых мутаций в генеалогии редкого генетического варианта[10].
2024 год
- В октябре в журнале Nature была опубликована работа, посвящённая «горячим точкам» мутаций в половых клетках человека. Команда исследователей, включавшая Сюняева, разработала системный подход для выявления генов, которые являются движущей силой клональной экспансии в сперматогониях. Проанализировав данные более 800 тысяч человек, учёные выявили 23 гена-кандидата, управляющих этим процессом. Исследование показало, что положительный отбор в мужских половых клетках может повышать распространённость некоторых генетических заболеваний[11].
- В июне на сервере препринтов bioRxiv была размещена работа, согласно которой генетическая архитектура большинства сложных признаков и заболеваний человека объясняется моделью стабилизирующего отбора[12].
- В феврале был представлен препринт исследования, в котором описывались новые статистические методы для совместного геномного анализа пациентов с ультраредкими моногенными заболеваниями[13].
Научное руководство
Под руководством Шамиля Сюняева защитили диссертации и прошли постдокторскую подготовку ряд учёных, продолживших карьеру в академических кругах и индустрии. Среди его учеников:
- Люк О'Коннор (англ. Luke O'Connor) — бывший аспирант, основал собственную исследовательскую группу, является преподавателем на кафедре биомедицинской информатики Гарвардской медицинской школы и ассоциированным членом Институт Броуда[14].
- Дэниел Джордан (англ. Daniel Jordan) — после защиты диссертации под руководством Сюняева стал инструктором на кафедре генетики и геномных наук в Медицинской школе Икан на горе Синай.
- Кори Бакаларски (англ. Corey Bakalarski) — занимает должность старшего главного научного сотрудника (англ. Senior Principal Scientist) в биотехнологической корпорации Genentech.
Семья
Шамиль Сюняев женат. Есть сын — Рауф и дочь Адиля.