Система информации о морском биоразнообразии
Система информации о морском биоразнообразии (англ. Ocean Biodiversity Information System, OBIS, ранее — Ocean Biogeographic Information System) — веб-ориентированная платформа для доступа к информации о распространении и численности живых видов в океане. Она была разработана как компонент управления информацией десятилетнего проекта по переписи морской жизни (CoML) (2001—2010), однако не ограничивается только данными, полученными в рамках CoML, и стремится предоставить интегрированный обзор всех данных о морском биоразнообразии, которые могут быть предоставлены ей на условиях открытого доступа соответствующими держателями данных. Согласно информации на официальном сайте по состоянию на июль 2018 года, OBIS «является глобальным центром открытых данных и информации о морском биоразнообразии для науки, охраны природы и устойчивого развития». На сайте OBIS перечислены 8 конкретных целей, первая из которых — «Предоставить крупнейшую в мире научную базу знаний о разнообразии, распространении и численности всех морских организмов в интегрированном и стандартизированном формате»[1].
Общие сведения
| Система информации о морском биоразнообразии | |
|---|---|
| URL | www.obis.org |
| Коммерческий | нет |
| Тип сайта | веб-ориентированная система данных и информации |
| Язык (-и) | английский |
| Текущий статус | активна |
История и современное состояние
Первые идеи создания OBIS были выработаны на встрече CoML, посвящённой бентосной (донной) жизни океана, в октябре 1997 года. Рекомендации этого семинара привели к созданию веб-сайта http://marine.rutgers.edu/OBIS в Ратгерском университете в 1998 году для демонстрации первоначальной концепции OBIS[2]. Учредительный международный семинар OBIS состоялся 3-4 ноября 1999 года в Вашингтоне (округ Колумбия), где были определены рамки проекта и начата работа по привлечению потенциальных партнёров; избранные материалы были опубликованы в специальном выпуске журнала Oceanography[3]. В этом выпуске основатель OBIS доктор Дж. Ф. Грассл изложил видение OBIS как «онлайн, всемирного атласа для доступа, моделирования и картирования данных о морской биологии в многомерном географическом контексте»[4]. В мае 2000 года государственные агентства США в рамках Национальной программы партнёрства по океанографии совместно с Фондом Альфреда П. Слоуна профинансировали восемь исследовательских проектов для запуска OBIS. В мае 2001 года Национальный научный фонд США выделил финансирование Ратгерскому университету для разработки глобального портала OBIS. Также в 2001 году был сформирован Международный комитет OBIS, первое заседание которого состоялось в августе 2001 года[5].
Рабочая версия портала OBIS была запущена в Ратгерском университете в 2002 году как сайт http://www.iobis.org, предоставлявший доступ к 430 000 геопривязанным записям о видах из 8 партнёрских баз данных, включая данные о рыбах из FishBase, головоногих из CephBase, кораллах из Biogeoinformatics of Hexacorals, моллюсках из Indo-Pacific Mollusc Database и других[6]. К маю 2006 года портал OBIS обеспечивал доступ к 9,5 миллионам записей о 59 000 видах из 112 баз данных[7], а к декабрю 2010 года (по завершении Переписи морской жизни) предоставлял доступ к 27,7 миллионам записей, представляющим 167 000 таксонов[8]. По состоянию на июль 2018 года сайт OBIS сообщает, что система предоставляет доступ к более чем 45 миллионам наблюдений почти по 120 000 морских видов (уменьшение числа названий связано с разрешением синонимии, то есть сведением таксонов, зарегистрированных под разными именами, к одному принятому названию), на основе вкладов 500 учреждений из 56 стран[9].
В 2009 году OBIS был принят в качестве проекта Международной программы по обмену океанографическими данными и информацией (IODE) Межправительственной океанографической комиссии (МОК) ЮНЕСКО, а в 2011 году, после прекращения финансирования секретариата и портала в Ратгерском университете со стороны Фонда Слоуна, было принято предложение о размещении системы в Фламандский морской институт (VLIZ) в Остенде, Бельгия, который стал долгосрочным хостом системы, а секретариат OBIS был переведён из Ратгерского университета в проектный офис МОК по IODE в Остенде, откуда в настоящее время осуществляется поддержка и дальнейшее развитие OBIS. Таким образом, OBIS теперь располагается в Остенде, в том же здании, где находится и VLIZ. VLIZ поддерживает две таксономические базы данных — Всемирный реестр морских видов и IRMNG (Временный реестр морских и неморских родов), обе из которых используются для таксономических решений, определяющих отображение информации о видах в OBIS, а также предоставляют таксономическую иерархию для навигации по содержимому OBIS. В настоящее время OBIS находится под управлением IODE при поддержке управляющей группы — IODE Steering Group for OBIS (SG-OBIS); операционная деятельность координируется Исполнительным комитетом OBIS (OBIS-EC) при поддержке различных рабочих групп OBIS и временных проектных команд. Секретариат OBIS, размещённый в проектном офисе ЮНЕСКО/МОК по IODE в Остенде (Бельгия), включает менеджера проекта OBIS и менеджера данных и, помимо поддержки системы, также обеспечивает обучение и техническую помощь поставщикам данных, разрабатывает новые стандарты данных и технические решения, а также способствует международному сотрудничеству для развития сетевого эффекта[10].
Данные, доступные через OBIS, охватывают все группы организмов, имеющих какое-либо отношение к морским или эстуарным средам обитания, включая также прибрежные зоны и атмосферу над океаном, такие как морские позвоночные (рыбы, морские млекопитающие, черепахи, морские птицы и др.); морские беспозвоночные (включая зоопланктон); морские бактерии; и морские растения (например, фитопланктон, морские водоросли, мангры).
Портал OBIS
По мере развития веб-технологий портал OBIS прошёл несколько этапов модернизации с момента своего создания в 2002 году. Изначально система извлекала удалённые данные в реальном времени по запросу пользователя и использовала KGS Mapper для визуализации результатов. В 2004 году была внедрена централизованная индексация метаданных и кэширование, что привело к ускорению и повышению надёжности работы, а также был добавлен c-squares mapper для визуализации данных[11]. В 2010 году впервые была внедрена полноценная веб-ГИС-система вместе с новой версией сайта, что позволило значительно более детально и гибко представлять результаты поиска и добавило ряд новых опций поиска[12]. В апреле 2018 года было объявлено о финансировании разработки новой версии OBIS «2.0» с расширенными возможностями[13], которая была выпущена 29 января 2019 года[14]. URL сайта изменился с iobis.org на obis.org.
Региональные узлы OBIS
С 2004 года была создана международная сеть региональных узлов OBIS, которые способствуют подключению источников данных в своих регионах к основной сети данных OBIS, а также всё чаще предоставляют специализированные сервисы или представления данных OBIS для пользователей в своих регионах.
- Антарктический OBIS
- Хостинг — Belgian Biodiversity Platform, Брюссель и Фламандский морской институт, Остенде. Управляющий: Бруно Дэнис
- Аргентина
- Хостинг — Centro Nacional Patagonico (CENPAT) — CONICET. Управляющий: Мирта Льюис
- Австралия
- Хостинг — Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation — Oceans and Atmosphere. Управляющий: Дэйв Уоттс
- Канада
- Хостинг — Centre of Marine Biodiversity и Bedford Institute of Oceanography. Управляющий: Боб Брентон
- Китай
- Хостинг — Institute of Oceanology. Управляющий: Сун Сяося
- Европа
- Хостинг — Vlaams Instituut voor de Zee. Управляющий: Уорд Аппельтанс
- Индийский океан
- Хостинг — National Chemical Laboratory и National Institute of Oceanography. Управляющий: Баба Инголе
- Япония
- Хостинг — National Institute for Environmental Studies. Управляющий: Юнко Симура
- Новая Зеландия / Юго-Западная часть Тихого океана
- Хостинг — National Institute of Water & Atmospheric Research. Управляющий: Дон Робертсон
- Субсахарская Африка
- Хостинг — Southern African Data Centre for Oceanography. Управляющий: Мартен Грюндлин
- Филиппины
- Хостинг — ASEAN Centre for Biodiversity. Управляющий: Кристиан Эллоран
- Тропическая и субтропическая восточная часть южной части Тихого океана
- Хостинг — University of Concepcion. Управляющий: Рубен Эскрибандо
- Тропическая и субтропическая западная часть южной Атлантики
- Хостинг — University of Sao Paulo (USP) и Reference Center on Environmental Information (CRIA). Управляющий: Фабио Ланг Да Сильвейра
- Соединённые Штаты Америки
- Хостинг — United States Geological Survey (USGS). Управляющий: Эбби Бенсон.
См. также.mw-parser-output .ts-Портал{background:#f8f9fa;border:1px solid #a2a9b1;clear:right;float:right;font-size:90%;margin:0 0 .5em 1em;padding:.4em;max-width:19em;width:19em;line-height:1.5}.mw-parser-output .ts-Портал th,.mw-parser-output .ts-Портал td{padding:.25em 0;vertical-align:middle}.mw-parser-output .ts-Портал th+td{padding-left:.4em}@media(max-width:719px){.mw-parser-output .ts-Портал{box-sizing:border-box}}
Примечания
Литература
- Grassle, J.F. и Stocks, K.I., 1999. A Global Ocean Biogeographic Information System (OBIS) for the Census of Marine Life. Oceanography 12(3), с. 12-14.
- Grassle, J.F. 2000. The Ocean Biogeographic Information System (OBIS): an on-line, worldwide atlas for accessing, modeling and mapping marine biological data in a multidimensional geographic context. Oceanography 13(3), с. 5-7.
- Zhang, Y. и Grassle, J.F. 2003. A portal for the Ocean Biogeographic Information System. Oceanologica Acta 25(5), с. 193—197.
- Mark J. Costello, J. Frederick Grassle, Yunqing Zhang, Karen Stocks, and Edward Vanden Berghe 2005. Where is what and what is where? Online mapping of marine species. MarBEF Newsletter. Весна 2005, с. 20-22.
- Wood J.B., Zhang, P.Y., Costello, M.J. и Grassle, J.F. 2006. An introduction to OBIS, www.iobis.org. В: Miloslavich P. и Klein E. (ред.), Caribbean marine biodiversity: the known and the unknown. DEStech Publications Inc., Ланкастер, Пенсильвания, США, с. 253—254.
- Costello M.J., Stocks K., Zhang Y., Grassle J.F., Fautin D.G. 2007. About the Ocean Biogeographic Information System. Получено с http://hdl.handle.net/2292/5236
- Edward Vanden Berghe, Karen I. Stocks и J. Frederick Grassle. 2010. Data Integration: The Ocean Biogeographic Information System. Глава 17 (с. 333—353) в Alasdair D. McIntyre (ред.): Life in the World’s Oceans. Blackwell Publishing Ltd. Глава также доступна по адресу http://www.comlmaps.org/mcintyre/ch17/data-integration-the-ocean-biogeographic-information-system Архивировано 7 мая 2017 года..
- Vanden Berghe E, Halpin P, Lang da Silveira F, Stocks K и Grassle F. 2010. Integrating biological data into ocean observing systems: The future role of OBIS. В: Hall J, Harrison D E, и Stammer D (ред.) Proceedings of OceanObs’09: Sustained Ocean Observations and Information for Society (Том 2). Париж, European Space Agency Publication No WPP-306.
- Costello M.J., Vanhoorne B., Appeltans W. 2015. Progressing conservation of biodiversity through taxonomy, data publication and collaborative infrastructures. Conservation Biology 29 (4), 1094—1099.
Ссылки
- AfrOBIS: региональный узел OBIS для Субсахарской Африки
- EurOBIS: европейский узел OBIS
- IndOBIS: узел OBIS для Индийского океана
- OBIS Australia: австралийский региональный узел OBIS
- OBIS China: китайский региональный узел OBIS
- OBIS Southwestern Pacific: юго-западный тихоокеанский региональный узел OBIS
- SCAR-MarBIN: Антарктическая сеть информации о морском биоразнообразии
- SEAOBIS: узел OBIS для Юго-Восточной Азии
- US OBIS: региональный узел OBIS для США
- OBIS Canada: канадский региональный узел OBIS