Ретротранспозоны

Ретротранспозоны (мобильные генетические элементы первого типа, или транспозоны, перемещающиеся через РНК-интермедиаты) — это генетические элементы, которые могут самовоспроизводиться в геноме и являются вездесущими компонентами ДНК многих эукариотических организмов.

Ретротранспозоны являются подклассом транспозонов. Ретротранспозоны широко распространены у растений, где они часто являются важным компонентом ядерной ДНК. У кукурузы 49-78 % генома состоит из ретротранспозонов,[1] у пшеницы около 90 % генома представлены повторяющими последовательностями, из них 68 % — перемещающимися элементами.[2] У млекопитающих практически половина генома (45-48 %) состоит из транспозонов или остатков транспозонов. Примерно 42 % генома человека состоит из ретротранспозонов, и около 2-3 % — из ДНК-транспозонов.[3]

Классификация

Ретротранспозоны, или мобильные генетические элементы первого типа, состоят из двух подтипов — ретротранспозонов с длинными концевыми повторами (англ. LTR, long terminal repeats), и ретротранспозонов без длинных концевых повторов.

Последние в свою очередь делятся на длинные диспергированные повторы (англ. LINEs, long interspersed elements) и короткие диспергированные повторы (англ. SINE, short interspersed elements).

Примечания

Литература

  • Жимулев И. Ф. Общая и молекулярная генетика. — 1. — Новосибирск: Издательство Новосибирского университета, 2002. — 459 с. — 2000 экз. — ISBN 5761505096.
  • Liu, J., Gao, M., He, J., Wu, K., Lin, S., Jin, L., ... & Chen, J. (2021). The RNA m6A reader YTHDC1 silences retrotransposons and guards ES cell identity. Nature, 591(7849), 322-326. PMID 33658714 doi:10.1038/s41586-021-03313-9
  • Billon, V., & Cristofari, G. (2021). Nascent RNA m6A modification at the heart of the gene–retrotransposon conflict. Cell Research, 1-3. doi:10.1038/s41422-021-00518-5
  • Xu, Z., Ma, A. & Ma, Y.C. (2021). RNA methylation preserves ES cell identity by chromatin silencing of retrotransposons. Sig Transduct Target Ther 6, 258 . doi:10.1038/s41392-021-00683-4

См. также

Категории