Полиуридилирование
Полиуридилирование (от греч. πολύς — многий, многочисленный[1]; уридин — рибонуклеозид, состоящий из урацила и D-рибозы[2]) — процесс добавления уридиновых нуклеотидов к 3'- концу молекул РНК. Это один из видов модификации (процессинга) РНК наряду с полиаденилированием, играет важную роль в клеточном метаболизме[3].
История открытия
С конца 1950-х годов известны ферменты поли(U)полимеразы, которые способны добавлять остатки уридина к 3'-концу кодирующих или некодирующих РНК, однако значение этой модификации недооценивалось. В середине 1980-х годов были открыты механизмы редактирования вставки/удаления уридина в митохондриях кинетопластид. Позже было показано, что этот процесс имеет решающее значение для функционирования мРНК, для повышения эффективности трансляции. Затем были получены доказательства роли полиуридилирования в процессинге молекул направляющих РНК и процессе трансляции митохондриальных мРНК. Позже появились сведения о полиуридилировании у высших эукариот. Дальнейшие исследования показали, что этот процесс является важным для деградации неполиаденилированных мРНК, которые кодируют гистоновые белки у млекопитающих. Также стало известно, что полиуридилирование происходит и в других типах молекул РНК, таких как микроРНК, малых интерферирующих РНК (миРНК) и малых некодирующих РНК (пиРНК), с различными функциональными последствиями[3].
Локализация в клетке и значение
В ядре клетки процессам полиуридилирования подвергаются, например, U6 мяРНК с помощью U6 терминальной уридилтрансферазы (U6 TUTase), которая является важным ферментом для выживания клеток млекопитающих. Сайленсинг U6 TUTase, соответственно, отсутствие полиуридилирования приводит к распаду U6 мяРНК. U6 TUTase обеспечивает добавление по крайней мере четырёх остатков уридина. Остатки уридина образуют внутримолекулярную двойную нить с участком аденина внутри молекулы U6 мяРНК. Таким образом процесс уридилирования обеспечивает синтез сплайсинг-компетентной U6 мяРНК, это в свою очередь будет иметь важное значение для сплайсинга РНК. Уридилирование U6 мяРНК млекопитающих in vivo сопровождается добавлением до 20 нуклеотидов на 3'-конце молекулы РНК. Молекулы U6 мяРНК также подвергается аденилированию, этот процесс ингибирует её уридилирование[3].
Митохондрии — одни из первых органоидов клетки, процессы уридилирования в которых были исследованы у кинетопластид. Полиуридилированию у этих организмов подвергаются направляющие РНК и мРНК. Так у трипонасомы направляющие РНК отвечают за направление механизма редактирования РНК к своим мРНК-мишеням, поэтому имеют решающее значение для выживания этого паразита. У человека при определённых условиях в митохондриях также были отмечены РНК с поли(U)-хвостами[3].
Цитоплазматическое полиуридилирование происходит на различных молекулах РНК: полиаденилированных и неполиаденилированных мРНК, малых РНК, миРНК, пиРНК. Уридилирование цитоплазматических мРНК человека, по-видимому, приводит к деградации мРНК. Такой механизм описан для гистон-кодирующих мРНК после ингибирования репликации ДНК и завершения S-фазы клеточного цикла. На этом этапе гистоновые мРНК должны деградировать. Исследования на различных животных и растительных объектах демонстрируют антагонистическую роль уридилирования и метилирования. Важную роль в биологических процессах играет уридилирование малых некодирующих РНК. У Arabidopsis thaliana уридилирование олигоаденилированных мРНК, по-видимому, способствует стабилизации мРНК[3].Уридилирование РНК — мощный и широко распространённый посттранскрипционный регулятор экспрессии генов[4].
Значение исследований для медицины
У млекопитающих цитоплазматическое уридилирование РНК связывают с индуцированием роста опухолей[3], процессами пролиферации, поддержания стволовых клеток, с иммунной защитой организма против вирусов, ретротранспозонов[4]. Однако целостное биологическое значение этого процесса требует дальнейшего уточнения. Проложение исследований на кинетопластидах, вероятно, помогу в поиске лечения смертельно опасной сонной болезни[3].