АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыМатериалы БРЭСпецпроектыСтать автором
Настроить видСменить язык
О РУВИКИ
Ответ на вопрос

Конкурс Эббе Нильсена

Pause

Конкурс Эббе Нильсена (англ. Ebbe Nielsen Challenge) — международный научный конкурс, ежегодно проводимый с 2015 года Глобальной информационной системой по биоразнообразию (GBIF). В рамках конкурса присуждаются денежные призы за проекты исследователей, направленные на создание программного обеспечения или подходов, успешно решающих задачи, поставленные GBIF в области информатики биоразнообразия. Конкурс является преемником Премии Эббе Нильсена, вручавшейся GBIF ежегодно с 2002 по 2014 год. Название конкурса дано в память о выдающемся энтомологе и стороннике информатики биоразнообразия Эббе Нильсене, скончавшемся от сердечного приступа в США по пути на заседание Правления GBIF в 2001 году.

История

В 2001 году GBIF учредила Премия Эббе Нильсена в честь недавно скончавшегося датско-австралийского энтомолога Эббе Нильсена, который был активным сторонником как самой GBIF, так и дисциплины информатики биоразнообразия[1]. Эта премия отмечала мирового исследователя или исследовательскую команду за их вклад в развитие информатики биоразнообразия, согласно критериям, установленным GBIF в условиях награждения. С 2015 года GBIF перезапустила процесс вручения премии в формате конкурса между отдельными исследователями или командами для создания новых программных решений или подходов к использованию данных о биоразнообразии по ежегодно объявляемой тематике, а также для распределения призового фонда между несколькими группами вместо одного победителя, как это было на начальном этапе премии[2]. Приём заявок на конкурс, получивший название «Конкурс Эббе Нильсена», проводится ежегодно с 2015 года по настоящее время, а победители определяются на конкурсной основе во все годы, кроме 2017 года, когда было подано недостаточно заявок[3].

Список победителей, начиная с 2015 года

2015

Задача: «Существенно использовать данные, предоставляемые GBIF, для создания новых представлений или получения новых знаний. Ваша заявка может включать различные результаты — веб-сайты, автономные или мобильные приложения, результаты анализа — либо быть направлена на улучшение различных процессов, включая (но не ограничиваясь) анализ или визуализацию данных, рабочие процессы, загрузку или аннотирование.»[4][5][6]

Победитель первой премии:

  • GBIF Dataset Metrics — Питер Десмет, Барт Аэлтерман и Николя Ноэ (Бельгия)[7]

Победитель второй премии:

  • BioGUID.org — Ричард Пайл (США)[8]

2016

Задача: «В 2016 году конкурс сосредоточен на вопросах пробелов и полноты данных, поиске инструментов, методов и механизмов для анализа пригодности данных GBIF и/или определения приоритетов для мобилизации данных о биоразнообразии. Ожидается, что как пользователи, так и держатели данных получат выгоду от акцента на пробелах и полноте.»[9][10][11]

Победитель первой премии:

  • Exploring ignorance in space and time — Алехандро Руэте (Аргентина)[12]

Совместные победители второй премии:

  • sampbias — Александр Зицка, Александр Антонелли и Даниэле Сильвестро (Швеция)[13]
  • GBIF Coverage Assessment Tools — Вальтер Йетц, Джереми Мальчик, Карстен Майер, Мишель Дуонг, Аджай Ранипета и Луис Х. Вильянуэва (США, ЮАР и Германия)[14]

2017

Задача: «Конкурс 2017 года GBIF Ebbe Nielsen Challenge принимает заявки, которые перепрофилируют эти наборы данных [в общедоступных репозиториях с открытым доступом] и адаптируют их к формату Darwin Core Archive (DwC-A), совместимому и повторно используемому стандарту, который обеспечивает публикацию почти 800 миллионов записей о встречаемости видов из почти 1000 учреждений по всему миру, входящих в сеть GBIF. В 2017 году конкурс ставит перед разработчиками и специалистами по данным задачу создать веб-приложения, скрипты или другие инструменты, автоматизирующие поиск и извлечение соответствующих данных о биоразнообразии из открытых репозиториев данных.»[15]

Победители не были объявлены, призовой фонд 2017 года не был присуждён ни одной заявке.

2018

Задача: «Конкурс 2018 года Ebbe Nielsen Challenge намеренно открыт, поэтому участники имеют широкий мандат на создание инструментов и методов, способствующих развитию открытой науки и улучшению доступа, полезности или качества данных GBIF. Заявки могут быть новыми приложениями, методами визуализации, рабочими процессами или анализами, либо расширять существующие инструменты и функции.»[16][17][18]

Совместные победители первой премии:

  • Checklist recipe: a template for reproducible standardization of species checklist data — Лиен Рейсерхове, Дамиано Олдони и Питер Десмет (Бельгия)[19]
  • Ozymandias: a biodiversity knowledge graph — Родерик Д. М. Пейдж (Великобритания)[20]

Совместные победители второй премии:

  • The bdverse — Томэр Гуэта, Йохай Кармель, Виджай Барве, Тилошон Нагараджах, Повилас Гибас, Ашвин Агравал (Израиль, США, Шри-Ланка, Литва и Индия)[21]
  • GBIF Issues Explorer — Луис Х. Вильянуэва (США)[22]
  • Smart mosquito trap to DwC pipeline — Коннор Хоуингтон и Сэмюэл Ранд (США)[23]
  • Taxonomy Tree Editor — Аших Сингх Томар (Испания)[24]

2019

Задача: «Конкурс 2019 года Ebbe Nielsen Challenge намеренно открыт, поэтому участники имеют широкий мандат на создание инструментов и методов, способствующих развитию открытой науки и улучшению доступа, полезности или качества данных GBIF. Заявки могут быть новыми приложениями, методами визуализации, рабочими процессами или анализами, либо расширять существующие инструменты и функции. Ожидается, что успешные заявки предоставят практические решения для сети GBIF, способствуя развитию информатики биоразнообразия и управлению данными о биоразнообразии в соответствии с миссией и стратегическим планом GBIF.»[25][26]

Победитель первой премии:

  • WhereNext: a recommending system to identify sampling priorities based on generalized dissimilarity modeling — Хорхе Веласкес-Тибата (Колумбия)[27]

Совместные победители второй премии:

  • occCite: Tools to Enable Comprehensive Biodiversity Data Citation — Ханна Л. Оуэнс, Кори Меро, Брайан С. Майтнер, Виджай В. Барве и Роберт Гуралник (Дания, США)[28]
  • Organella — Андреа Бидерманн, Диана Герт, Димитар Русзев и Пауль Рёдер (Германия)[29]
  • Rapid Least Concern: Automated assessments of lower risk plants for the IUCN Red List of Threatened Species (Red List) — Стивен Бахман, Барнаби Уокер и Джастин Моат (Великобритания)[30]

Совместные победители третьей премии:

  • Agile GBIF Publishing — Евгений Мейке (Финляндия)[31]
  • Biodiversity Information Review and Decision Support: the BIRDS package for R — Дебора Арлт, Алехандро Руэте и Антон Хаммарстрём (Швеция)[32]
  • GB Sifter: A GBIF to GenBank Data Sifter — Луис Альенде (США)
  • naturaList — Артур Винисиус Родригес и Габриэл Накамура (Бразилия)[33]
  • GeoNature-atlas: Publish an online biodiversity atlas with GBIF data of your area — Жордан Селлис, Амандин Саль (Франция)[34]

2020

Задача: «Конкурс 2020 года Ebbe Nielsen Challenge намеренно открыт, поэтому участники имеют широкий мандат на создание инструментов и методов, способствующих развитию открытой науки и улучшению доступа, полезности или качества данных GBIF. Заявки могут быть новыми приложениями, методами визуализации, рабочими процессами или анализами, либо расширять существующие инструменты и функции. Ожидается, что успешные заявки предоставят практические решения для сети GBIF, способствуя развитию информатики биоразнообразия и управлению данными о биоразнообразии в соответствии с миссией и стратегическим планом GBIF.»[35][36]

Победитель первой премии:

  • ShinyBIOMOD: An R application for modelling species distribution — Иан Ондо, Вильфрид Тюйе, Майя Гегуэн, Александр Антонелли и Самюэль Пиронон (Великобритания, Франция, Швеция)[37]

Совместные победители второй премии:

  • Linking nomenclature to type specimens — Маартен Трекелс (Бельгия)[38]
  • InteractIAS: A Jupyter notebook to support expert risk assessment on invasive species — Квентин Грум (Бельгия, ЮАР)[39]

Совместные победители третьей премии:

  • DNA barcode browser — Родерик Д. М. Пейдж (Великобритания)
  • Voyager — Иввет Абдулла-Модину и Бен Скотт (Великобритания)[40]
  • Mass Georeferencing Tool — Луис Х. Вильянуэва (США)[41]

2021

Задача: «Конкурс 2021 года Ebbe Nielsen Challenge намеренно открыт, поэтому участники имеют широкий мандат на создание инструментов и методов, способствующих развитию открытой науки и улучшению доступа, полезности или качества данных GBIF. Заявки могут быть новыми приложениями, методами визуализации, рабочими процессами или анализами, либо расширять существующие инструменты и функции. Ожидается, что успешные заявки предоставят практические решения для сети GBIF, способствуя развитию информатики биоразнообразия и управлению данными о биоразнообразии в соответствии с миссией и стратегическим планом GBIF.»[42][43]

Победитель первой премии:

  • Bio-Dem: Biodiversity knowledge & democracy — Александр Зицка, Оскар Рюден, Даниэль Эдлер, Йоханнес Кляйн, Стаффан Линдберг и Александр Антонелли (Германия, Швеция, Великобритания)[44]

Совместные победители второй премии:

  • Locating KBAs: An automated workflow for identifying potential Key Biodiversity Areas — Даниэла Линеро Триана (Колумбия)[45]
  • plantR: An R package for managing species records from biological collections — Ренато А. Феррейра де Лима, Андреа Санчес-Тапиа, Сара Р. Мортара, Ханс тер Стиге и Маринез Ф. де Сикейра (Бразилия, Нидерланды)[46]

2022

Задача: «Конкурс 2022 года Ebbe Nielsen Challenge намеренно открыт, поэтому участники имеют широкий мандат на создание инструментов и методов, способствующих развитию открытой науки и улучшению доступа, полезности или качества данных GBIF. Заявки могут быть новыми приложениями, методами визуализации, рабочими процессами или анализами, либо расширять существующие инструменты и функции. Ожидается, что успешные заявки предоставят практические решения для сети GBIF, способствуя развитию информатики биоразнообразия и управлению данными о биоразнообразии в соответствии с миссией и стратегическим планом GBIF.»[47][48]

Совместные победители первой премии:

  • bdc: A toolkit for standardizing, integrating and cleaning biodiversity data — Бруно Р. Рибейро, Сантьяго Хосе Элиас Веласко, Карло Гвидони-Мартинс, Гейзиане Тессароло, Лукас Жардим, Стивен П. Бахман и Рафаэль Лойола (Бразилия, Аргентина, Великобритания)[49]
  • GridDER: Grid Detection and Evaluation in R — Сяо Фэн, Тайна Роша, Ханна Т. Таммавонг, Рима Тулайха, Син Чен, Иньин Се и Даниэль Парк (США, Бразилия)

Победитель второй премии:

  • GBIF LACS: GBIF Literature Abstract Classification System — Анхель Луис Роблес Фернандес и Натан Апхэм (США)

2023

Задача: «Конкурс 2023 года Ebbe Nielsen Challenge намеренно открыт, поэтому участники имеют широкий мандат на создание инструментов и методов, способствующих развитию открытой науки и улучшению доступа, полезности или качества данных GBIF. Заявки могут быть новыми приложениями, методами визуализации, рабочими процессами или анализами, либо расширять существующие инструменты и функции. Ожидается, что успешные заявки предоставят практические решения для сети GBIF, способствуя развитию информатики биоразнообразия и управлению данными о биоразнообразии в соответствии со стратегической рамкой GBIF.»[50][51]

Победитель первой премии:

  • GBIF Alert: an open-source GBIF-based alert system for occurrences — Николя Ноэ, Питер Десмет, Тим Адрианс, Брам Д’Хондт, Лиен Рейсерхове и Дамиано Олдони (Бельгия)

Победитель второй премии:

  • Frictionless Data from Bionomia — Дэвид Шортхаус (Канада)[52]

Совместные победители третьей премии:

  • Library of Identification Resources — Ларс Виллигаген (Нидерланды)[53]
  • Open Data Biodiversity Mapper — Сэм Венаас Перрин, Филип Стэнли Мостерт и Рон Тогунов (Норвегия)[54]

2024

Задача: «Конкурс Ebbe Nielsen Challenge намеренно открыт. Участники имеют широкий мандат на создание и совершенствование инструментов и методов, способствующих развитию открытой науки и улучшению доступа, качества и полезности данных GBIF. Заявки могут быть новыми приложениями, методами визуализации, рабочими процессами или анализами, либо расширять существующие инструменты и функции. Ожидается, что успешные заявки предоставят практические решения для сети GBIF, способствуя развитию информатики биоразнообразия и управлению данными о биоразнообразии, особенно в соответствии со стратегической рамкой GBIF.»[55][56]

Победитель первой премии:

  • ChatIPT — Рукайя Джохаадиен (Норвегия)

Победитель второй премии:

  • Planetary Knowledge Base — Цяньцянь (Хирис) Гу, Бен Скотт и Винс Смит (Великобритания)

Победитель третьей премии:

  • CoreTech Assistant — Чен Яо

Примечания

  1. ↑ Kristensen, Niels P. (2001). “Ebbe Schmidt Nielsen 7 June 1950 - 6 March 2001”. Nota Lepidopterologica. 24 (3): 3—9.
  2. ↑ GBIF Ebbe Nielsen Challenge. GBIF Ebbe Nielsen Challenge.
  3. ↑ 2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge now open. iphylo.blogspot.com (9 мая 2018).
  4. ↑ Winners named for first GBIF Ebbe Nielsen Challenge. www.gbif.org.
  5. ↑ Finalists for GBIF Ebbe Nielsen Challenge. dna-barcoding.blogspot.com (16 апреля 2015).
  6. ↑ GBIF Ebbe Nielsen Challenge: Bringing biodiversity information to life. www.gbif.org.
  7. ↑ GBIF dataset metrics. chrome.google.com.
  8. ↑ BioGUID.org - Cross-linking data Across the Biodiversity Universe through the use of unique identifiers and related data objects. devpost.com.
  9. ↑ GBIF 2016 Ebbe Nielsen Challenge: Analysing and addressing gaps and biases in primary biodiversity data. www.gbif.org.
  10. ↑ GBIF 2016 Ebbe Nielsen Challenge. www.biodiv.be.
  11. ↑ Data 'ignorance mapping' entry wins 2016 Ebbe Nielsen Challenge. www.gbif.org.
  12. ↑ SLU scientist won a prize for 'Ignorance mapping'. www.slu.se.
  13. ↑ sampbias - Evaluating geographic sampling biases in species distribution datasets. devpost.com (28 сентября 2016).
  14. ↑ GBIF Coverage Assessment Tools - Online tools to identify and track gaps in GBIF-mediated data to characterize species distributions in space and time. devpost.com (29 сентября 2016).
  15. ↑ Liberating species records from open data repositories for scientific discovery and reuse. www.gbif.org.
  16. ↑ 2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge seeks open-data innovations for biodiversity. www.gbif.org.
  17. ↑ 2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge. www.europeandataportal.eu.
  18. ↑ Six winners top the 2018 Ebbe Nielsen Challenge. www.gbif.org.
  19. ↑ Desmet, Peter; Oldoni, Damiano; Reyserhove, Lien (2018-11-20). “Checklist Recipe - How we created a template to standardize species data”. ropensci.org. DOI:10.59350/t4ra9-gw580.
  20. ↑ Prof Roderic Page Wins Ebbe Nielsen Prize. Глазговский университет.
  21. ↑ bdverse: Biodiversity Data Cleaning Framework. www.researchgate.net.
  22. ↑ The Smithsonian Institution's Digitization Program Office wins prize in GBIF 2018 Ebbe Nielsen Challenge. dpo.si.edu.
  23. ↑ VectorBase team members among the six 2018 Ebbe Nielsen Challenge winners. www.vectorbase.org.
  24. ↑ BLOG POST: Visual exploration of taxonomic, phylogenomic and biodiversity data. big4-project.eu.
  25. ↑ 2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge seeks open-data innovations for biodiversity. www.gbif.org.
  26. ↑ WhereNext wins 2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge. www.gbif.org.
  27. ↑ WhereNext: a recommending system to identify sampling priorities based on generalized dissimilarity modeling. rpubs.com.
  28. ↑ occCite: Tools to Enable Comprehensive Biodiversity Data Citation. github.com.
  29. ↑ Organella. netlify.com.
  30. ↑ Rapid Least Concern: Automated assessments of lower risk plants for the IUCN Red List of Threatened Species (Red List). shinyapps.io.
  31. ↑ Agile GBIF Publishing. earthcape.com/ (31 июля 2019).
  32. ↑ Biodiversity Information Review and Decision Support: the BIRDS package for R. github.com.
  33. ↑ naturaList. shinyapps.io.
  34. ↑ GeoNature-atlas: Publish an online biodiversity atlas with GBIF data of your area. ecrins-parcnational.com.
  35. ↑ 2020 Ebbe Nielsen Challenge seeks open-data innovations for biodiversity (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  36. ↑ ShinyBIOMOD wins 2020 GBIF Ebbe Nielsen Challenge (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  37. ↑ Ian Ondo / ShinyBIOMOD · GitLab (англ.). GitLab. Дата обращения: 16 августа 2025.
  38. ↑ AgentschapPlantentuinMeise/linkedTaxonomy. Botanic Garden Meise (25 июля 2023). Дата обращения: 16 августа 2025.
  39. ↑ AgentschapPlantentuinMeise/interactias. Botanic Garden Meise (7 ноября 2024). Дата обращения: 16 августа 2025.
  40. ↑ React App. voyager-gbif.netlify.app. Дата обращения: 16 августа 2025.
  41. ↑ Smithsonian/Mass-Georeferencing. Smithsonian Institution (30 марта 2023). Дата обращения: 16 августа 2025.
  42. ↑ 2021 Ebbe Nielsen Challenge seeks open-data innovations for biodiversity (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  43. ↑ Bio-Dem wins 2021 GBIF Ebbe Nielsen Challenge (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  44. ↑ #bio-dem (англ.). Bio-Dem: Biodiversity knowledge & democracy. Дата обращения: 16 августа 2025.
  45. ↑ Daniela Linero - National Audubon Society Locating KBAs: An automated workflow for identifying potential Key Biodiversity Areas. dlinero-kbas.github.io. Дата обращения: 16 августа 2025.
  46. ↑ Lima, Renato LimaRAF/plantR (25 апреля 2025). Дата обращения: 16 августа 2025.
  47. ↑ 2022 Ebbe Nielsen Challenge seeks open-data innovations for biodiversity (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  48. ↑ GridDER and bdc share top honors in 2022 GBIF Ebbe Nielsen Challenge (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  49. ↑ Biodiversity Data Cleaning (англ.). brunobrr.github.io. Дата обращения: 16 августа 2025.
  50. ↑ (closed) 2023 Ebbe Nielsen Challenge seeks open-data innovations for biodiversity (исп.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  51. ↑ Belgian-built GBIF Alert system wins the 2023 Ebbe Nielsen Challenge (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  52. ↑ Bionomia (англ.). bionomia.net. Дата обращения: 16 августа 2025.
  53. ↑ Library of Identification Resources. identification-resources.github.io. Дата обращения: 16 августа 2025.
  54. ↑ The Open Data Biodiversity Mapper. swp-data-projects.shinyapps.io. Дата обращения: 16 августа 2025.
  55. ↑ 2024 Ebbe Nielsen Challenge seeks open-data innovations for biodiversity (closed) (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.
  56. ↑ ChatIPT system wins the 2024 Ebbe Nielsen Challenge (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 16 августа 2025.

Категории

Pause