Компьютерный синтез


Компьютерный синтез (англ. Computer Assisted Synthesis Design) — область хемоинформатики, охватывающая методы, алгоритмы и реализующие их компьютерные программы, оказывающие помощь химику в планировании синтеза органических соединений, прогнозировании результатов и дизайне новых типов органических реакций на основе обобщения данных по известным синтетическим превращениям[1]. В более узком смысле, под компьютерным синтезом понимается проведение с помощью компьютера ретросинтетического анализа с целью выработки оптимальной схемы синтеза заданного химического соединения.

Ретросинтетический анализ

Эмпирический подход к компьютерному синтезу

Компьютерные программы, реализующие эмпирический подход к компьютерному синтезу:

  • LHASA (Logic and Heuristic Applied to Synthetic Analysis)
  • SECS (Simulation and Evaluation of Chemical Synthesis)
  • REACT (REACTion path synthesis program for the petrochemical industry)
  • SynGen (SYNthesis GENeration)
  • SYNCHEM (SYNthetic CHEMistry)
  • WODCA (Workbench for the Organization of Data for Chemical Applications)[2]
  • OSET (Organic Synthesis Exploration Tool)

Неэмпирический компьютерный синтез

Компьютерные программы, реализующие неэмпирический подход к компьютерному синтезу:

  • EROS (Elaboration of Reactions for Organic Synthesis)
  • TOSCA (Topological Synthesis design by Computer Application)
  • FLAMINCOES (Formal-Logical Approach to Molecular Interconversions)
  • COMPASS (COMputer-ASsisted organic Synthesis)

Синтез «вперёд»

Синтез «вперёд» предсказывает результат органических реакций для заданных исходных веществ, реагентов и условий проведения реакций. Предсказания даются на основе подробного рассмотрения механизмов реакций.

Компьютерные программы, реализующие синтез «вперёд»:

  • CAMEO (Computer Assisted Mechanistic Evaluation of Organic reactions)
  • ICAR

Дизайн новых типов органических реакций

Компьютерные программы, предназначенные для дизайна новых типов органических реакций путём формального перечисления различных способов перераспределения связей:

  • IGOR (Interactive Generation of Organic Reactions)
  • SYMBEQ (SYMBolic EQuations)[3]
  • ARGENT

Примечания

  1. R. Barone and M. Chanon. «Computer-Assisted Synthesis Design (CASD)». In «Chemoinformatics. From data to knowledge», J. Gasteiger, T. Engel Eds, J. Wiley, 2003, pp. 1428—1456
  2. M. Phoetner and M. Sitzmann. «Computer-Assisted Synthesis Design by WODCA (CASD)» In «Chemoinformatics. From data to knowledge», J. Gasteiger, T. Engel Eds, J. Wiley, 2003, pp. 1457—1507
  3. N. S. Zefirov, I. I. Baskin, V. A. Palyulin. SYMBEQ Program and Its Application in Computer-Assisted Reaction Design (англ.) // J. Chem. Inf. Comput. Sci. : journal. — 1994. — Vol. 34, no. 4. — P. 994—999. — doi:10.1021/ci00020a038.

Ссылки

Категории