АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

TCF21

TCF21 (Фактор транскрипции 21) также известный как pod-1[5], капсулин или эпикардин, представляет собой белок, который у человека кодируется геном TCF21 на 6-й хромосоме (6q23-q24) человека.[6][7] TCF21 является членом факторов транскрипции содержащих базовый структурный мотив bHLH, которые влияют на судьбу и дифференцировку клеток, регулируя экспрессию генов. Он играет важную роль в широком спектре биологических процессов, включая органогенез, эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП), клеточный цикл, аутофагию, пролиферацию, дифференцировку, и выживание клеток, а также метастазирование рака. Контролируемая экспрессия и активность TCF21 обеспечивают сбалансированную программу транскрипции, которая гарантирует соответствующий рост и созревание во время эмбриогенеза и развития органов. Нарушение его регуляции тесно связано с множеством заболеваний.[7] Его функция в основном регулируется некодирующими РНК, посттрансляционными модификациями и межбелковыми взаимодействиями.[8]

Появляется все больше доказательств того, что полиморфизм TCF21 может определять генетическую предрасположенность к ишемической болезни сердца[9] При многих типах рака человека ген TCF21 эпигенетически инактивирован.[7][10]

Общие сведения
TCF21
Идентификаторы
ПсевдонимыTCF21, POD1, bHLHa23, transcription factor 21
Внешние IDOMIM: 603306 MGI: 1202715 HomoloGene: 2414 GeneCards: TCF21
Расположение гена (человек)
Хр.6-я хромосома человека[1]
Локус6q23.2Начало133,889,113 bp[1]
Конец133,895,553 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.10-я хромосома мыши[2]
Локус10 A3|10 10.33 cMНачало22,693,180 bp[2]
Конец22,696,073 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung

  • lower lobe of lung

  • metanephric glomerulus
Наибольшая экспрессия в
  • left lung lobe

  • right lung lobe

  • septum transversum

  • endocardial cushion
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

6943

21412

Ensembl

ENSG00000118526

ENSMUSG00000045680

UniProt

O43680

O35437

RefSeq (мРНК)

NM_198392
NM_003206

NM_011545

RefSeq (белок)

NP_003197
NP_938206

NP_035675

Локус (UCSC)Chr 6: 133.89 – 133.9 MbChr 10: 22.69 – 22.7 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118526 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045680 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Quaggin SE, Vanden Heuvel GB, Igarashi P (February 1998). “Pod-1, a mesoderm-specific basic-helix-loop-helix protein expressed in mesenchymal and glomerular epithelial cells in the developing kidney”. Mechanisms of Development. 71 (1—2): 37—48. DOI:10.1016/S0925-4773(97)00201-3. PMID 9507058.
  6. ↑ Smith LT, Lin M, Brena RM, Lang JC, Schuller DE, Otterson GA, Morrison CD, Smiraglia DJ, Plass C (2006). Epigenetic regulation of the tumor suppressor gene TCF21 on 6q23-q24 in lung and head and neck cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103 (4): 982—987. PMC 1348006 PMID 16415157 doi:10.1073/pnas.0510171102
  7. ↑ 1 2 3 Lotfi, C. F. P., Passaia, B. S., & Kremer, J. L. (2021). Role of the bHLH transcription factor TCF21 in development and tumorigenesis. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, 54(5) e10637. PMID 33729392 PMC 7959166 doi:10.1590/1414-431X202010637
  8. ↑ Ao, X., Ding, W., Zhang, Y., Ding, D., & Liu, Y. (2020). TCF21: a critical transcription factor in health and cancer. Journal of Molecular Medicine, 98(8), 1055—1068. PMID 32542449 doi:10.1007/s00109-020-01934-7
  9. ↑ Hu, H., Lin, S., Wang, S., & Chen, X. (2020). The Role of Transcription Factor 21 in Epicardial Cell Differentiation and the Development of Coronary Heart Disease. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 8, 457. PMID 32582717 PMC 7290112 doi:10.3389/fcell.2020.00457
  10. ↑ Jiang, X., & Yang, Z. (2018). Multiple biological functions of transcription factor 21 in the development of various cancers. OncoTargets and therapy, 11, 3533. PMID 29950858 PMC 6016277 doi:10.2147/OTT.S164033

Категории