OpenBabel

OpenBabel
OpenBabel
Тип	Хемоинформатика
Написана на	C++
Операционная система	Кроссплатформенное программное обеспечение
Последняя версия	3.1.1 (8 мая 2020)
Репозиторий	github.com/openbabel/ope…
Читаемые форматы файлов:
	CML, International Chemical Identifier, MDL Molfile[d], Protein Data Bank[d], FASTA (формат), Alchemy Format[d], Gaussian Cube File[d], CDX Format[d], CIF, XYZ file format[d], Free Form Fractional format[d] и MCDL format[d]
Создаваемые форматы файлов:
	SMILES, CML, International Chemical Identifier, InChIKey[d], MDL Molfile[d], Multilevel Neighborhoods of Atoms format[d], Free Form Fractional format[d], MCDL format[d] и CAChe MolStruct[d]
Лицензия	GNU General Public License
Сайт	openbabel.sourceforge.net/…

OpenBabel
OpenBabel
Тип	Хемоинформатика
Написана на	C++
Операционная система	Кроссплатформенное программное обеспечение
Последняя версия	3.1.1 (8 мая 2020)
Репозиторий	github.com/openbabel/ope…
Читаемые форматы файлов:
	CML, International Chemical Identifier, MDL Molfile[d], Protein Data Bank[d], FASTA (формат), Alchemy Format[d], Gaussian Cube File[d], CDX Format[d], CIF, XYZ file format[d], Free Form Fractional format[d] и MCDL format[d]
Создаваемые форматы файлов:
	SMILES, CML, International Chemical Identifier, InChIKey[d], MDL Molfile[d], Multilevel Neighborhoods of Atoms format[d], Free Form Fractional format[d], MCDL format[d] и CAChe MolStruct[d]
Лицензия	GNU General Public License
Сайт	openbabel.sourceforge.net/…

OpenBabel — свободная химическая экспертная система, в основном используемая для преобразования форматов файлов. Эта программа доступна для UNIX и Windows и распространяется на условиях GNU GPL.

OpenBabel, так же как и JOELib, основан на библиотеке OELib, которая, в свою очередь, использовала идеи из программы Babel.

Химическая экспертная система
Преобразование форматов
Поиск фрагментов (с помощью SMILES)

QuteMol

↑ ¹ ² Chemical Markup Language (cml, mrv)
↑ ¹ ² ³ ⁴ ⁵ ⁶ ⁷ ⁸ Supported File Formats and Options
↑ ¹ ² InChI format (inchi)
↑ ¹ ² MDL MOL format (mol, mdl, sdf, sd)
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Protein_Data_Bank_format.html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/FASTA_format.html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Alchemy_format.html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Gaussian_cube_format.html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/ChemDraw_binary_format.html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Crystallographic_Information_File.html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/XYZ_cartesian_coordinates_format.html
↑ ¹ ² http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Free_Form_Fractional_format.html
↑ SMILES format (smi, smiles)
↑ InChIKey (inchikey)
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Multilevel_Neighborhoods_of_Atoms_(MNA).html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/MCDL_format.html
↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/CAChe_MolStruct_format.html

Домашняя страница OpenBabel Архивная копия от 25 февраля 2008 на Wayback Machine

[_49b0c7ff45b8ed0c-1] ¹ ² Chemical Markup Language (cml, mrv)

[_c8066a5e2a51036a-2] ¹ ² ³ ⁴ ⁵ ⁶ ⁷ ⁸ Supported File Formats and Options

[_b4e0d8ce4598a659-3] ¹ ² InChI format (inchi)

[_de6632be1edf2e02-4] ¹ ² MDL MOL format (mol, mdl, sdf, sd)

[_00ff6bd42bbb5c4f-5] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Protein_Data_Bank_format.html

[_c2f174564ac3d043-6] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/FASTA_format.html

[_1b92b1bc00d68ce3-7] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Alchemy_format.html

[_efcc7f1d1e93dd63-8] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Gaussian_cube_format.html

[_db3bb2839430785b-9] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/ChemDraw_binary_format.html

[_8dc8d9623cac6eab-10] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Crystallographic_Information_File.html

[_5418346c5bd7dadf-11] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/XYZ_cartesian_coordinates_format.html

[_bf2b3b0cf6b99e13-12] ¹ ² http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Free_Form_Fractional_format.html

[_e2058193dc77ee9a-13] SMILES format (smi, smiles)

[_1aaf6a4d9d623fe5-14] InChIKey (inchikey)

[_171714b7ce24a811-15] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Multilevel_Neighborhoods_of_Atoms_(MNA).html

[_f69885371ee6eba5-16] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/MCDL_format.html

[_6ecea10b212352d3-17] ttp://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/CAChe_MolStruct_format.html

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

OpenBabel

Основные возможности

См. также

Примечания

Ссылки

Категории