Dicer

Dicer
Dicer
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ
Идентификаторы
Псевдонимы	DICER1, DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW
Внешние ID	OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	14-я хромосома человека
Конец	95,158,010 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	12-я хромосома мыши
Конец	104,718,211 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	caput epididymis; ; corpus epididymis; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; inferior ganglion of vagus nerve;
	Наибольшая экспрессия в
	secondary oocyte; ; medullary collecting duct; ; primitive streak; ; maxillary prominence; ; superior cervical ganglion;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	нуклеотид-связывающий; helicase activity; protein domain specific binding; pre-miRNA binding; связывание с ионом металла; endoribonuclease activity; endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters; связывание с белками плазмы; siRNA binding; RNA binding; nuclease activity; double-stranded RNA binding; endonuclease activity; гидролазная активность; АТФ-связанные; ribonuclease III activity; ДНК-связывающий; deoxyribonuclease I activity;
Компонент клетки	цитоплазма; цитозоль; RNA-induced silencing complex; Конус роста; ARC complex; RISC-loading complex; аксон; дендрит; клеточное ядро; endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; экзосома;
Биологический процесс	neuron projection morphogenesis; RNA processing; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; peripheral nervous system myelin formation; pre-miRNA processing; positive regulation of myelination; nerve development; RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; positive regulation of Schwann cell differentiation; negative regulation of Schwann cell proliferation; production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; miRNA metabolic process; production of siRNA involved in RNA interference; Подавление экспрессии генов; apoptotic DNA fragmentation; negative regulation of tumor necrosis factor production; NIK/NF-kappaB signaling; negative regulation of gene expression; tube formation;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	23405
	192119
	ENSG00000100697
	ENSMUSG00000041415
	Q9UPY3
	Q8R418
	NM_001195573; NM_001271282; NM_001291628; NM_030621; NM_177438
	NM_148948
	NP_001182502; NP_001258211; NP_001278557; NP_085124; NP_803187
	NP_683750
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Dicer
Dicer
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ
Идентификаторы
Псевдонимы	DICER1, DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW
Внешние ID	OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	14-я хромосома человека
Конец	95,158,010 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	12-я хромосома мыши
Конец	104,718,211 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	caput epididymis; ; corpus epididymis; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; inferior ganglion of vagus nerve;
	Наибольшая экспрессия в
	secondary oocyte; ; medullary collecting duct; ; primitive streak; ; maxillary prominence; ; superior cervical ganglion;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	нуклеотид-связывающий; helicase activity; protein domain specific binding; pre-miRNA binding; связывание с ионом металла; endoribonuclease activity; endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters; связывание с белками плазмы; siRNA binding; RNA binding; nuclease activity; double-stranded RNA binding; endonuclease activity; гидролазная активность; АТФ-связанные; ribonuclease III activity; ДНК-связывающий; deoxyribonuclease I activity;
Компонент клетки	цитоплазма; цитозоль; RNA-induced silencing complex; Конус роста; ARC complex; RISC-loading complex; аксон; дендрит; клеточное ядро; endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; экзосома;
Биологический процесс	neuron projection morphogenesis; RNA processing; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; peripheral nervous system myelin formation; pre-miRNA processing; positive regulation of myelination; nerve development; RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; positive regulation of Schwann cell differentiation; negative regulation of Schwann cell proliferation; production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; miRNA metabolic process; production of siRNA involved in RNA interference; Подавление экспрессии генов; apoptotic DNA fragmentation; negative regulation of tumor necrosis factor production; NIK/NF-kappaB signaling; negative regulation of gene expression; tube formation;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	23405
	192119
	ENSG00000100697
	ENSMUSG00000041415
	Q9UPY3
	Q8R418
	NM_001195573; NM_001271282; NM_001291628; NM_030621; NM_177438
	NM_148948
	NP_001182502; NP_001258211; NP_001278557; NP_085124; NP_803187
	NP_683750
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двуцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA) и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3'-конце^[5].

Dicer содержит два домена RNase III и один домен PAZ. Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA^[6].

РНК-интерференция

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

Dicer

См. также

Примечания

Категории