В стеблях эндодерма мало дифференцирована и обычно содержит крахмальные зёрна, отчего её ещё называют крахмалоносным влагалищем[2]. В корнях радиальные и поперечные стенки клеток эндодермы имеют утолщения в виде поясков, содержащие суберин и лигнин (эти пояски называются поясками Каспари), тонкостенными остаются пропускные клетки этого слоя. Таким образом, эндодерма является физиологическим барьером, регулирующим поступление воды и ионов из первичной коры в центральный цилиндр корня[3].
В старых корнях однодольных растений эндодерма состоит из клеток двух типов: живых тонкостенных пропускных и клеток с U-образными утолщениями оболочек[4].