Сигнальный пептид
Сигнальный пептид, или сигнальная последовательность, — короткая (от 3 до 60 аминокислот) аминокислотная последовательность в составе белка, которая обеспечивает котрансляционный или посттрансляционный транспорт белка в соответствующую органеллу (ядро, митохондрия, эндоплазматический ретикулум, хлоропласт, апопласт или пероксисома). После доставки белка в органеллу сигнальный пептид может отщепляться под действием специфической сигнальной протеазы.
Типы сигнальных пептидов
| Органелла | Аминокислотная последовательность |
|---|---|
| клеточное ядро | -Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val- |
| транспортировка к эндоплазматическому ретикулуму | H2N-Met-Met-Ser-Phe-Val-Ser-Leu-Leu-Leu-Val-Gly-Ile-Leu-Phe-Trp-Ala-Thr-Glu-Ala-Glu-Gln-Leu-Thr-Lys-Cys-Glu-Val-Phe-Gln- |
| задержка в эндоплазматическом ретикулуме | -Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val- |
| митохондрия (матрикс) | H2N-Met-Leu-Ser-Leu-Arg-Gln-Ser-Ile-Arg-Phe-Phe-Lys-Pro-Ala-Thr-Arg-Thr-Leu-Cys-Ser-Ser-Arg-Tyr-Leu-Leu- |
| пероксисома (PTS1) | -Ser-Lys-Leu-COOH |
| пероксисома (PTS2) | H2N-----Arg-Leu-X5-His-Leu- |
См. также
Ссылки
- Сигнал (пептид) сортировки белков
- Транспорт макромолекул
- SPdb (База данных сигнальных пептидов) Архивная копия от 22 января 2016 на Wayback Machine
- SignalP — предсказание наличия и локализации сайтов отщепления сигнального пептида в аминокислотных последовательностях различных организмов.