Эти места заселили ещё македоняне. Во времена Византии здесь была построена крепость Пентикион или Пантикапеум («Пять стен» или «Пять ворот»), которая в XI—XV веках, во время борьбы византийцев с турками, не раз переходила из рук в руки.
Район Пендик был выделен из района Ускюдар 4 июля 1987 года.