Несходство Брея — Кёртиса
Несходство Брея — Кёртиса в экологии и биологии — это статистика, используемая для количественной оценки различия в видовом составе между двумя разными участками на основе учёта численности на каждом участке. Названа в честь Дж. Роджера Брея и Джона Т. Кёртиса, которые впервые представили её в статье в 1957 году[1].
Определение
Несходство Брея — Кёртиса между двумя участками j и k определяется как
где — количество экземпляров вида i на участке j, — количество экземпляров вида i на участке k, а p — общее число видов в выборках.
В альтернативной сокращённой записи — это сумма меньших значений численности каждого вида. и — общее количество учтённых экземпляров на обоих участках. Индекс может быть упрощён до 1-2C/2 = 1-C, если численности на каждом участке выражены в долях, однако обе формы уравнения дают совпадающие результаты только тогда, когда общее количество экземпляров на обоих участках одинаково. Более подробное рассмотрение приведено у Лежандра и Лежандра[2].
Несходство Брея — Кёртиса ограничено значениями от 0 до 1, где 0 означает, что оба участка имеют одинаковый состав (то есть содержат все одни и те же виды), а 1 — что участки не имеют общих видов. При промежуточных значениях BC (например, BC = 0,5) этот индекс отличается от других часто используемых индексов[3].
Несходство Брея — Кёртиса непосредственно связано с количественным индексом сходства Сёренсена для тех же участков:
- .
Несходство Брея — Кёртиса часто ошибочно называют расстоянием («Хорошо определённая функция расстояния подчиняется неравенству треугольника, однако существует несколько обоснованных мер различия между выборками, которые не обладают этим свойством: чтобы отличать их от истинных расстояний, мы часто называем их несходствами»[4]). Это не расстояние, так как оно не удовлетворяет неравенству треугольника, и всегда должно называться несходством во избежание путаницы.
Пример
| Вид | Аквариум 1 | Аквариум 2 | Min |
|---|---|---|---|
| Золотая рыбка | 6 | 10 | 6 |
| Гуппи | 7 | 0 | 0 |
| Радужница | 4 | 6 | 4 |
| Итого | 17 | 16 | 10 |
Для простого примера рассмотрим данные из двух аквариумов с 3 видами рыб, как показано в таблице. В таблице приведено количество каждого вида в каждом аквариуме, а также некоторые статистики, необходимые для вычисления несходства Брея — Кёртиса.
Для вычисления несходства Брея — Кёртиса сначала определим — сумму только меньших значений численности для каждого вида, встречающегося на обоих участках. Золотая рыбка встречается на обоих участках; меньшее значение — 6. Гуппи есть только на одном участке, поэтому меньшее значение — 0 и не вносит вклад в сумму. Радужница также есть в обоих, и меньшее значение — 4. Таким образом, .
(общее количество экземпляров на участке j) , а
(общее количество экземпляров на участке k) .
Это приводит к .
Примечания
Литература
- Czekanowski J (1909) Zur Differentialdiagnose der Neandertalgruppe. Korrespbl dt Ges Anthrop 40: 44-47.
- Ricotta C & Podani J (2017) On some properties of the Bray-Curtis dissimilarity and their ecological meaning. Ecological Complexity 31: 201—205.
- Somerfield, PJ (2008) Identification of Bray-Curtis similarity index: comment on Yoshioka (2008). Mar Ecol Prog Ser 372: 303—306.
- Yoshioka PM (2008) Misidentification of the Bray-Curtis similarity index. Mar Ecol Prog Ser 368: 309—310. http://doi.org/10.3354/meps07728