С 1910 года он работал в Киеве и Ростове-на-Дону в частных садоводческих хозяйствах помощником садовода, где хорошо усвоил практику садоводства.
В 1914 году его пригласили заведовать в Ростове-на-Дону плодово-декоративным питомником.
В 1916 году был призван на военную службу и направлен на железную дорогу в Прохладный, Кабардино-Балкарии, который тогда ещё имел статус поселка. Узнав о его специальности, руководство решило использовать его знания на благо железной дороги. В 1918 году был назначен назначают заведующим плодово-декоративного питомника при железнодорожной станции Нальчик.
Здесь проявил большую активность по комплектованию питомника разнообразным ассортиментом плодовых культур, различных сортов роз и других растений.
В 1930—1932 годах работал в Кабардино-Балкарском курортном управлении.
С 1933 года и до конца дней работал в оранжерейно-цветочном хозяйстве Кабардино-Балкарского областного комитета КПСС, переданном в 1950 году в ведение треста «Госзеленхоз» Министерства коммунального хозяйства РСФСР[2] (ныне Муниципальное унитарное опытно-показательное сельскохозяйственное предприятие «Декоративные культуры» Нальчика)
Выращенные Ковтуненко голубые ели, розы, плодовые и ягодные культуры украшали не только сады и парки Кабардино-Балкарии, но и направлялись в Москву, Ростов-на-Дону, Куйбышев, Пятигорск и другие города страны.
Роза «Кабардинка» (Пернецианские розы — Rosa pernettiana horticultural). Розы выведены в результате скрещивания ремонтантной розы Антуан Дюше с крупными блестящерозовыми цветками с жёлтой капуциновой розой Першен Иеллоу и повторного скрещивания полученного гибрида Солейль д’Ор с чайно-гибридными розами. Розы этой группы имеют цветки желтых, оранжевых, золотистых, шоколадных, шарлаховых тонов.
За выращивание особо ценных культур плодовых, декоративных, цветочных и вечнозеленых растений руководимое им хозяйство было участником ВСХВ в Москве и неоднократно награждалось дипломами, грамотами и медалями.[источник не указан 1372 дня]