Интеграза
Интеграза (IN) — фермент, катализирующий интеграцию (включение) ДНК вируса (ретровируса, в частности, ВИЧ[1][2]) в хромосому клетки-хозяина. Перед интеграцией линейные молекулы ДНК вируса сначала замыкаются в кольцо и затем уже встраиваются.
Ретровирусные интегразы — ключевой компонент прединтеграционного комплекса (PIC).
Сходные ферменты фагов — phage integrase, например λ phage integrase (Int).
Общие сведения
| Цинк-связывающий домен интегразы | |
|---|---|
| Идентификаторы | |
| Символ | Integrase Zn |
| Pfam | PF02022 |
| InterPro | IPR003308 |
| SCOP | 1wjb |
| SUPERFAMILY | 1wjb |
| Доступные структуры белков | |
| Pfam | структуры |
| PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
| PDBsum | 3D-модель |
Структура
Все ретровирусные интегразы состоят из трех канонических доменов:
- N-концевой цинк-связывающий домен с мотивом HHCC (например, His12 His16 Cys40 Cys43 у ВИЧ-1);
- каталитический домен (RNaseH);
- C-концевой ДНК-связывающий домен (SH3).
Изучена структура доменов интеграз вирусов HIV-1, HIV-2, SIV, Rous Sarcoma Virus (RSV), первые результаты опубликованы в 1994 году. Имеются данные, свидетельствующие, что интеграза функционирует как тетрамер. Несколько белков клетки взаимодействуют с интегразой, в частности, человеческий хроматин-ассоциированный LEDGF.
Интеграза ВИЧ
Вирус иммунодефицита человека содержит интегразу размером 32 кДа в гене Pol. Данный фермент является перспективной целью для ВААРТ. Используется 3 препарата, являющихся ингибиторами интегразы ВИЧ: Ралтегравир (RAL, Исентресс, с 2007 года), Долутегравир (DTG, Тивикай), Элвитегравир (EVG, с 2012 года)[3]
Примечания
Ссылки
- Retroviral Integrase Structure and DNA Recombination Mechanism. / Microbiol Spectr. 2014;2(6):1-22.
- Retroviral integrase proteins and HIV-1 DNA integration. / J Biol Chem. 2012 Nov 30;287(49):40858-66. doi:10.1074/jbc.R112.397760
- Retroviral Integrase, Putting the Pieces Together / The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 1996
Дополнительно по теме
 |
|---|
