Начало творческой деятельности положили занятия в литературном объединении «Тан солбаны» («Утренняя звезда»). В 1977 году закончил Ленинградский государственный институт театра, музыки и кино по специальности «театральный художник». Работал в драматическом театре Златоуста, на киностудии «Казахфильм», художником-постановщиком в театрах Хакасии. В 1988 году закончил Высшие театральные курсы по специальности «Драматургия», в 2001 году — аспирантуру в Хакасском государственном университете.
Его пьесы пользуются популярностью в репертуаре Хакасского национального драматического театра имени А. М. Топанова и Хакасского музыкально-драматического театра «Читиген»: «Абахай пахта» (1990), «Небылицы Албанаха» (1993), «Белый бык» (1994), «Караван жизни» (2005), «Доблестный предок, подобный барсу» (2006). Трагедия «Абахай пахта» была удостоена Государственной премии Министерства культуры СССР и награждена дипломом 1-й степени на фестивале тюркоязычных театров в Уфе (2000)[1]. Написал более десяти пьес, пишет также рассказы.
Автор художественного оформления более 100 пьес, был художником-постановщиком первой хакасской оперы. В живописи предпочитает хакасские национальные темы — «Портрет шамана», «Забытый бог», «Хакасская стрела», «Седло дедушки», «Портрет Катанова», триптих «Мир». Лауреат специальной премии ТЮРКСОЙ в области изобразительного искусства (2005).
А. И. Котожекову принадлежит авторство государственного герба Республики Хакасия[2], он является исследователем традиционной культуры и верований хакасов. Председатель религиозного Совета тенгрианАбакана. Автор более 20 научных работ, книги гаданий «Толкелиг кинде» («Опыт реконструкции нумерологических оснований традиционного мировоззрения хакасов»)[3]. Член Омской лаборатории драматургов Сибири.
В настоящее время работает директором Дома литераторов Хакасии.